甘蓝叶色基因ygl-1和BoPr的遗传分析及精细定位

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:q87995210
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
甘蓝种属于十字花科芸薹属,包含了结球甘蓝、羽衣甘蓝、青花菜、花椰菜、抱子甘蓝等变种。在所有甘蓝变种中,叶色大多以绿色为主,而结球甘蓝和羽衣甘蓝两个变种的叶色变异相对更丰富,结球甘蓝叶色包括绿色、灰绿色、深绿色、紫色等;而羽衣甘蓝叶色有紫色、红色、绿色、粉色或白色等。为深入揭示控制甘蓝叶色变异的遗传基础,本研究以不同叶色的甘蓝自交系为材料,构建分离群体对两个甘蓝叶色基因(黄绿叶和紫色叶片)进行精细定位,在精细定位区间内,根据甘蓝参考基因组注释信息筛选和克隆候选基因。主要结果如下:1.结球甘蓝黄绿叶基因ygl-1的遗传分析及基因定位以结球甘蓝黄绿叶突变体YL-1(P1)及正常叶色结球甘蓝自交系01-20(P2)为亲本,构建分离群体进行遗传分析,进一步验证了黄绿叶色由核隐性单基因控制,命名为ygl-1。定位结果发现ygl-1基因与InDel标记ID2和M8连锁,遗传距离分别为0.4 cM和0.35 cM。根据02-12参考基因组信息,这两个标记间的物理距离为167kb,然而当将ID2和M8比对到TO1000参考基因组时,两标记的物理距离为11.41 Mb,根据遗传图和物理图的对应关系,推测02-12基因组存在组装错误。进一步以TO1000为参考基因组重新设计引物,将ygl-1基因定位于InDel标记T1-36和T1-58之间,遗传距离分别为0.42cM和0.42 cM,物理距离为11.47Mb。重组率比正常甘蓝基因组低约20倍,表明该区间内仍存在重组抑制。上述结果表明该区段内的重组抑制并不是由于变种间的结构变异所导致的,推测可能是由于YL-1在该区段的变异导致的重组抑制。2.羽衣甘蓝紫叶基因BoPr的遗传分析和精细定位以紫叶羽衣甘蓝自交系P1835和白叶羽衣甘蓝自交系W1827为亲本,构建F2和BC1分离群体,遗传分析表明紫叶性状是由单显性基因控制,命名为BoPr。利用基于02-12参考基因组设计的引物将BoPr基因定位于C09的280kb物理区域内,与BoPr基因连锁的侧翼标记M17和BOID4714,遗传距离分别为4.3 cM和1.5 cM。该区段的重组率比正常水平高12倍,且侧翼标记M17和BOID4714在TO1000参考基因组中的物理距离为12.73Mb,分析可能是02-12参考基因组在该区段存在组装错误。基于TO1000甘蓝参考基因组重新进行引物设计,新设计的InDel标记BRID485和BRID490与BoPr基因连锁,遗传距离分别为0.1cM和0.2cM,两标记间的物理距离为44.8 kb(TO1000参考基因组)。在44.8 kb区域内共有7个注释基因,只有基因Bo9g058630与拟南芥AT5G42800同源(二氢黄酮醇还原酶),编码花青素合成途径中的一个重要的酶,因此我们把Bo9g058630作为BoPr的候选基因。对该基因的序列变异分析发现,在白叶亲本W1827中该基因存在大片段的插入缺失,推测这导致该基因丧失功能,从而呈现出白色叶片的表型。根据双亲候选基因的序列差异,我们设计三条引物同时加到一次PCR反应中检测双亲、F2和BC群体的基因型,从而实现了该标记的共显性,将该标记命名为630-F-ZBR。
其他文献
在显示和照明领域,有机电致发光器件(OLED)因具有高发光效率、可制成柔性、易制备和成本低等优势而受到了广泛的研究。石墨烯具有极高的载流子迁移率、良好的透过率和优异的
微电子和半导体技术的发展是“互联网+”发展的基石。在半导体制造领域中,IC(Integrated Circuit)装备工艺腔室内压强和温度的均匀性是影响沉积生产工艺质量的关键因素。采用模
自我国1994年分税制改革以来,为了缩小地区间发展差距,协调地区间平衡发展,中央政府不断加大对落后地区的财政支持,以扶持落后地区发展。民族地区转移支付政策是我国自2000年
本文研究建立了中华蜜蜂(Apis cerana cerana Fab.,简称中蜂)胚胎石蜡切片技术,获得了中华蜜蜂典型胚胎发育时期的显微实体照片,对中华蜜蜂胚胎发育阶段进行了划分,印证和补
研究目的:为了研究炎症因子NLRP12在结直肠癌肿瘤形成中的作用以及它对于结直肠癌细胞化疗药物耐药性的影响。方法:在我们本次实验中,我们通过免疫组织化染色法测得了57例结
本文以对外汉字教学为出发点,努力探求趣味性教学法在对外汉字教学中的应用,为对外汉语教学事业做出自己的贡献。本文将对外汉字的趣味性教学法在对外汉语教学中的实际应用进行探究。在对研究课题的相关背景等情况做出简单阐述后,首先从对外汉字教学的难点、原则等几个方面介绍了对外汉字教学的基本情况。其次对对外汉字趣味性教学法涉及的一些理论进行了适当的分析。最后对收集到的各种具体的对外汉字趣味性教学法进行初步汇总,
涡轮叶片型面换热计算对于真实叶型的冷却结构优化和几何外形改进十分重要。影响叶型表面换热的因素有很多,如叶栅进出口雷诺数、湍流度、叶型曲率、边界层转捩等。经研究表
民营经济是中国经济的重要组成部分。民营企业的发展壮大可以促进国家税收的增长、国民收入的提高,对于调整国家经济结构、促进市场经济平稳运行也有着重要贡献。然而民营企
随着经济的迅速发展,企业面对的动态环境比以前更加复杂和不稳定,导致传统的经营理念、管理手段及静态思维模式难以满足企业适应时代的需求。因此,寻求长久的生产与发展的突
在平常电源波形,变频器电路波形等波形,都是用示波器来观察,假设我使用常规的无源探头,因为接地问题,会有很多危险因素存在,对于这种问题,我们可以使用高压差分探头来解决,因