高新技术企业是国民经济的战略性先导，在推进经济发展方式转变和产业机构调整的过程中，高新技术企业起着重要的作用。虽然我国高新技术企业的创新实力在逐步加强，结构在逐步优化，国际化水平在不断提升，但是我国的高新技术企业仍然以加工装配为主，产品附加值低，企业创新能力低下，主要还是依靠廉价的劳动力来赚取利润，我国的大部分高新技术企业走的仍是低成本发展的老路，属于低成本的高新技术企业。随着世界经济的发展，各种原材料成本的上升，这种采用低成本方式经营的高新技术企业已经不能适应时代的发展潮流，我国低成本高新技术企业的发展面临着严峻的挑战。低成本的生产方式如何适应现阶段的全球竞争环境和发展方式的转变，如何利用创新来帮助低成本高新技术企业寻找新的发展机遇，成为了现阶段亟待解决的问题。本文以某市2011年高新技术企业的数据为样本，研究低成本高新技术企业内部技术创新效率的现状。文章从资产周转率和营业利润率两个维度从200家高新技术企业中识别出78家低成本企业,将这78家识别出的企业作为低成本高新技术企业，进行创新效率的分析。文章以识别出的78家低成本高新技术企业为研究对象，计算这些企业的技术创新效率值，分析这些企业的创新情况。文章从创新投入和创新产出两个方面选择了科技经费投入量、科技人员人数、企业拥有的有效专利数和新产品销售收入四项指标，来作为计算低成本高新技术企业创新效率的依据。为了使结果更加可靠，文章使用随机前沿法和数据包络法计算了低成本高新技术企业的技术创新效率。对得出的结果，文章使用相关系数法和聚类分析法加以比较，发现两种方法得到的结果基本一致：低成本高新技术企业中存在着技术创新，虽然一些企业的技术创新效率处于较高的水平，但是从整体来看，低成本高新技术企业的创新效率值普遍偏低，存在着较大的提升空间。同时，文章还得到劳动力对于技术创新效率的贡献大于资本的贡献，企业创新效率低下的主要原因是技术创新匮乏的结论。在得到了企业的技术创新效率之后，文章从外部和内部两个方面从理论上分析了对企业技术创新效率可能产生影响的因素，并且利用DEA-Tobit模型建立了影响因素与创新效率的回归模型，从实证的角度验证了哪些因素最终决定了企业的技术创新效率值。文章研究结论显示企业规模、企业的成长能力、劳动者素质以及企业的管理能力对于技术创新效率都有显著的正向影响，政府的支持税收优惠政策和所选用的战略不能对企业的技术创新效率产生显著的影响。