新疆部分绵羊品种MHC classⅠ基因多态性研究

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绵羊主要组织相容性复合体(MajorHistocompatibilityComplex,MHC)又称OLA(OvineLeukocyteAntigens),是由染色体上紧密连锁高度多态的基因位点组成的遗传区域,编码基因分为I、II和III类三个区域。其中I类和II类基因的编码产物即I类和II类分子在激发机体产生免疫反应、抵御病原的抗原递呈方面发挥着十分重要的作用,因与许多疾病的抗性、易感性及生产性能都密切相关而成为研究的热点。目前人们对绵羊MHC的研究主要集中在II类区域的DR和DQ两个多态的基因座上,对绵羊MHCI类基因及其多态性的研究较少。对绵羊MHCI类基因的多态性的研究有助于丰富绵羊MHCI基因数据库,为抗病绵羊品种的选育提供帮助。为了研究新疆部分品种绵羊MHCI基因的序列特征及多态性,本实验以新疆四个绵羊品种:中国美利奴绵羊、哈萨克绵羊、萨福克绵羊和肉用美利奴绵羊共156只为研究对象,无菌采取抗凝血液,提取RNA,反转录成cDNA,PCR扩增绵羊MHCI基因重链和轻链mRNA全长,扩增产物经电泳检测显示重链长度为1107bp,目的基因经菌液PCR和双酶切鉴定为阳性后送生物公司测序;序列分析显示绵羊MHCI基因重链长度为1107bp,编码368个氨基酸,共含有8个外显子,碱基组成具有一定的不平衡性:A含量为19.26%,G含量为33.15%,T含量为18.26%,C含量为29.34%,GC含量(62.49%)明显高于AT含量(37.51%);是一个具有28个氨基酸长度信号肽的可溶性蛋白;其二级结构包含α-螺旋:29.51%、伸展条:29.23%、β-转角:9.84%、无规则卷曲:31.42%;与数据库中序列的同源性较高,达到了89.87-99.91%,系统发生分析显示获得的绵羊MHCI基因重链序列序列分为两个大的分支,且与数据库中的序列独立成簇。连接目的基因的T载体及真核表达载体pCDNA3.1(-)用内切酶EcoRI和XhoI酶切后,在T4连接酶的作用下进行连接反应,连接好的载体进行双酶切鉴定,为以后分析不同绵羊MHCI等位基因的功能奠定基础。获得的轻链序列长度为357bp,编码119个氨基酸,四种碱基的含量基本平衡,轻链序列的核苷酸同源性分析结果显示,与数据库中绵羊轻链的同源性为93.28%,与数据库中牛序列的同源性达到了98.88%,系统发生分析也得到了相同的结果。由于绵羊MHCI类基因全长序列中最多态的区域位于第二外显子和第三外显子编码的α1区域和α2区域,它们组成了MHCI类分子与抗原肽结合的区域,基本上能体现整个肽链的多态性,为了深入研究绵羊MHCI类分子的多态性。提取绵羊血液的基因组DNA,并以其为模版,扩增出不同绵羊品种MHCI基因重链的第二、三外显子基因,结果显示序列长度为1074bp,其中第二外显子序列长度为270bp,第三外显子序列长度为276bp。对序列分析结果显示绵羊MHCI基因重链的第二、三外显子具有较高水平的多态性,特别是与肽结合的区域及与T淋巴细胞受体相互作用区域,核苷酸置换分析结果显示核苷酸之间的转换率高于颠换率,正选择检验结果显示序列普遍受到较明显的正选择作用,系统发生分析结果显示绵羊MHCI类基因的第二、三外显子序列并不依据品种各自聚类,而是交叉聚类在一起。研究结果丰富了绵羊MHCI基因数据,为深入研究绵羊的MHC基因及其与致病性的关系和抗病育种提供基础。
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