HBV相关性肝细胞癌肝组织蛋白质组差异分析的初步研究

来源 :中南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nini863700
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
HBV相关性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)通常在慢性炎症坏死性肝病(包括肝硬化和慢性肝炎)的基础上发生,其癌变机制目前仍不明确。本试验旨在通过应用双向凝胶电泳和质谱技术,分析HBV相关性HCC癌组织与非癌肝组织蛋白质组之间的差异,鉴定肝组织蛋白质组中与HCC癌变相关的蛋白。 研究方法 1.样品选择与进行2-DE前的样品处理:18例HBV相关性HCC患者手术切除的癌组织和癌周组织,其中癌组织标本18例,癌周组织中,肝硬化组织标本12例,慢性肝炎组织6例。组织裂解液溶解肝组织,低温高速离心后吸取上清,经比色法测定蛋白浓度后置于-70℃冰箱中保存备用。 2.2-DE与凝胶图像分析:第一向固相pH梯度等电聚焦,随后在平衡液中平衡30min,接着进行第二向SDS-PAGE电泳。用硝酸银溶液银染使凝胶中的蛋白质点可视化。LabScan扫描凝胶成像,ImageMaster2D软件对癌组织、肝硬化和慢性肝炎组织凝胶进行蛋白质点的差异分析,选定感兴趣的差异蛋白质点。 3.MALDI-TOF肽质量指纹图谱与数据库搜索:切取凝胶内的目标 博士学位论文 中文摘要差异蛋白质点,经脱色、还原和烷基化,TPCK一胰蛋白酶酶解。以ZipTip**Cls吸头对样品进行脱盐,Pr*Flex**IllMALDITOF-MS测定其胶内酶解后的肽质指纹图谱,用Peptldent 软件查询SWISS-PROT/TrEMBL数据库(http:// www.exPasy.org)。 研究结果 1.差异分析:成功建立应用双向凝胶电泳分离肝组织蛋白质的方法,测得癌组织图谱平均每张蛋白斑点数为门 士 51)个,肝硬化组织图谱平均蛋白斑点数为门188士41)个,慢性肝炎组织图谱平均蛋白斑点数为门235士31)个。当某一蛋白质点在某一类型组织凝胶中表达较其他类型组织凝胶明显增强(校正后蛋白质点的表达量相差3倍以上人 并在不少于 50 %的该类组织凝胶图谱中表达,视其为差异蛋白质点。肝硬化组织VS癌组织,在癌组织凝胶中发现19个差异蛋白质点,在肝硬化组织凝胶中发现差异蛋白质点16个;慢性肝炎肝组织VS癌组织,在癌组织凝胶中发现21个差异蛋白质点,在慢性肝炎组织凝胶中发现差异蛋白质点 17个。癌组织 VS癌周组织(肝硬化组织十慢性肝炎组织人在癌组织凝胶中发现14个差异蛋白质点,在癌周组织凝胶中发现差异蛋白质点12个。 2.差异蛋白质点的鉴定:选取上述差异蛋白质点进行质谱分析,获得28张PMF,初步鉴定了其中的17张PMF。其中CDC27HS蛋白’、胰岛素刺激蛋白激酶1、甲胎蛋白前体、核纤层蛋白BI、细胞骨架蛋白8、Gankyrin、核仁磷酸化蛋白B23\胞浆纤维蛋白重链、c刁un氨基 IV 博士学位论文 中文摘要端激酶2n、ADP/ATP运输蛋白忖等10个蛋白质点,在癌组织20E凝胶图谱中表达明显增高涨*蛋白仅为癌组织VS慢性肝炎组织中的差异点蛋白质卜周期素依赖性激酶抑制蛋白12…16INK4A人周期素依赖激酶抑制蛋白1…21人抗氧化蛋白2\二硫化蛋白异构酶AZ\Cl一四氢叶酸合成酶\Rho七TPase一激活蛋白4\胰岛素样生长因子结合蛋白2“(带入标记蛋白仅为癌组织VS肝硬化组织中的差异点)等7个蛋白质点在癌周组织中表达明显增加。带个标记蛋白质在既往文献中未曾报道其与HCC相关。 研究结论 1.通过该研究成功地建立了一套包括双向凝胶电泳、凝胶图像分析、MALDI丁OF sk质量指纹图谱和蛋白质鉴定数据库搜索的肝组织蛋白质组的实验方法。 2.HBV相关性HCC的癌组织、肝硬化组织、慢性肝炎组织蛋白质组之间存在较明显的差异,表明慢性肝炎基础上发生的癌变与肝硬化基础上发生的癌变,其癌变机制存在差别。对本试验研究中初步鉴定出的差异蛋白质,尤其是既往文献中未曾报道与HCC相关的蛋白质,有助于研究HBV相关性HCC的癌变机制、肿瘤标记和治疗靶标。
其他文献
基于K irchoff定律,利用InGaAs/I半导体激光器及钽酸锂热释电探测器设计了一种实用化的实时测温系统。在着重讨论系统的测温不确定度(抗反射辐射光干扰的能力)及温度分辨力的
目的了解慢性肾脏病(CKD)在老年人群中的流行状况及常见危险因素。方法以简化的肾脏疾病饮食调整研究(MDRD)公式求肾小球滤过率估计值(eGFR),使用美国肾脏病诊治K/DOQI提出了CKD的
情境教学,是教师根据教学内容,创设形象生动的场景,让学生设身处地地感受的一种教学方法。一、问题情景创设 古人云“学起于思,思源于疑”,意思是有了“问题”才会有探究的欲望和
介绍了时钟扩频技术的原理、分类,结合它在摄像头的具体应用案例,与传统EMI抑制手段的实际效果进行对比,突显时钟扩频技术在抑制时钟EMI上的优势。
研究目的:拟采用锚固防护的边坡失稳很大程度是由于锚固不及时造成的,而目前锚固工程中的承压结构多为现浇而成,这样不可避免地拖延了防护加固时间。为避免边坡因此而失稳,特
雅思写作教学一直是雅思教学的薄弱环节。于20世纪80年代兴起的任务型教学法引起了外语教学实践者的广泛关注。本文在介绍理论的基础上,以雅思写作课堂教学为例,按照任务型教
目的:研究右归丸对肾阳虚大鼠垂体-肾上腺轴的动态影响。方法:(1)SD雄性大鼠90只,随机分为正常组、模型组和右归丸组。(2)氢化可的松注射液后肢肌肉注射,连续29 d,造成肾阳虚
农产品具有自然和经济两重属性,两重属性是产业选择的基本依据。在产业选择中要充分认识竞争优势之于产业选择的要义,以一体化发展思维统筹产业选择。农村产业选择要坚持精准
碳汇计量监测,就是通过对固定样地定期跟踪监测获取监测期内样地土地利用变化和碳库变化的过程。介绍了山西省碳汇计量监测体系建设现状,使更多的民众了解了碳汇计量监测的意
基因载体对于基因治疗成败起着关键作用,腺病毒载体(Adv)由于具有易于制备获得高滴度病毒、可转导分裂期和非分裂期细胞等优点而成为一种常用病毒载体,但由于存在基因转导的C