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老化作为一个复杂的生物学过程,其发展进程会严重影响心肌、骨骼肌、肝脏和脑组织的功能,甚至引发与这些组织年龄相关的疾病。miRNA、lncRNA和circRNA已经被发现与哺乳动物的老化存在密切关系,作为与这些RNA调控机制密切相关的竞争性内源RNA的调控作用也很可能在机体老化进程中起到重要作用。目前为止,鲜少有研究对心肌、骨骼肌、肝脏和脑组织老化相关的包括mRNA、lncRNA、miRNA和circRNA在内的转录水平的变化以及老化相关的竞争性内源RNA的共表达特征进行研究,尤其是在大型哺乳动物上的相关研究更是空白。猪与人类不仅具有相似的代谢功能、心血管系统、成比例的器官大小,其与人类在遗传学上也具有高度相似性,特别是遗传决定的代谢相似性,并且已经被作为生物医学模型用于研究人类相关的疾病。因此,本研究以180日龄和8周岁的雅南猪作为研究对象,基于RNA-seq测序技术和生物信息学分析,对青年和老年猪心肌、骨骼肌、肝脏和脑组织转录水平的共性和差异进行了分析,主要研究结果如下:(1)猪心肌组织中,26个mRNA、4个lncRNA、22个miRNA和26个circRNA随年龄变化呈现差异表达。与年轻个体相比,年老个体心肌组织中上调的基因与结构蛋白、甘油三酯分解代谢、氧的转运等有关,下调的基因与结构分子、基因的转录和钙结合能力等有关。(2)猪骨骼肌组织中,81个mRNA、5个lncRNA、79个miRNA和62个circRNA随年龄变化呈现差异表达。与年轻个体相比,年老个体骨骼肌组织中上调的基因与免疫反应、细胞分化、代谢过程、葡萄糖运输和凋亡过程等有关,下调的基因与结构蛋白、DNA结合、神经元发育和平滑结合等有关。(3)猪肝脏组织中,273个mRNA、19个lncRNA、26个miRNA和103个circRNA随年龄变化呈现差异表达。与年轻个体相比,年老个体肝脏组织中上调的基因与免疫应答、细胞分化调控、应激反应、脂质储存等有关,下调的基因与二磷酸酶活性、信号通路调控、代谢过程等有关。(4)猪脑组织中,714个mRNA、38个lncRNA、41个miRNA和148个circRNA随年龄变化呈现差异表达。与年轻个体相比,年老个体脑组织中上调的基因与生殖过程、免疫反应、运动和代谢过程等有关,下调的基因与神经功能、应激反应、信号通路和免疫反应等有关。(5)猪心肌组织ceRNA共表达网络中分别包含9个和4个年龄相关的miRNA和circRNA,总计11个共表达关系;猪骨骼肌组织ceRNA共表达网络中分别包含26个和17个年龄相关的miRNA和circRNA,总计69个共表达关系;猪肝脏组织ceRNA共表达网络中分别包含5个和13个年龄相关的miRNA和circRNA,总计13个共表达关系;猪脑组织ceRNA共表达网络中分别包含11个和54个年龄相关的miRNA和circRNA,总计62个共表达关系。(6)猪心肌、骨骼肌、肝脏和脑组织中绝大部分的mRNA、lncRNA、miRNA在年轻个体和年老个体上述组织内均呈现共表达,而仅有很少一部分的circRNA在年轻个体和年老个体上述组织内均呈现共表达。此外,上述组织年龄相关的基因的数目和生物学功能存在明显差异。本研究通过对青年和老年猪心肌、骨骼肌、肝脏和脑组织转录水平的共性和差异进行分析,有助于我们更好地理解猪上述组织老化相关的转录水平的变化规律。此外,研究结果还可以为雅南猪遗传资源保护和人的上述组织老化相关的分子调控机制的研究提供参考资料。