技术创新是推动世界经济持续向前发展的重要动力，是企业生存和发展的核心。企业技术创新投资活动中，新技术产出品的市场需求和与未来技术创新的环境均是不确定的，而且，这些随时间推进和企业决策逐步揭示的不确定性可以赋予企业决策的灵活性。然而，除了各种市场和技术不确定性外，诸如税收、破产成本和融资成本、企业利益相关者间的利益冲突，以及企业与外部投资者间的非对称信息等资本市场的不完美特征也会对企业技术创新投资决策产生重要影响。本文假设新技术的产出品价格服从几何布朗运动，对现有新技术价值冲击的未来创新依泊松过程出现，由特殊到一般、由简化到现实，逐步考虑并引入资本市场的不完美特征，运用实物期权方法构建不确定条件下企业技术创新投融决策的实物期权模型，并重点比较投融资交互关系随市场和技术两类不确定性的不同变化关系。首先，考虑债务融资的利息抵税好处和破产可能，给出同时含有市场和技术两类不确定性的技术创新投融资决策模型。通过考察投资门槛值、破产临界值和最优债务利息水平随市场和技术两类不确定性的变化关系发现：市场和技术两类不确定性都会延缓企业对新技术的采用；但是，它们对破产决策和最优债务利息水平具有相反的影响作用；而且，企业承担债务的能力和等待投资的灵活性之间具有相互增强的关系。其次，考虑更为一般化的情形，即经营状况变差时，企业可以通过支付融资成本或承受财务危机成本保持运营以等待经营好转，而非选择停止运营或破产的情形，研究得出融资约束会延缓企业采用新技术的基本结论，并通过比较融资约束延缓作用随市场和技术两类不确定性的变化关系发现，融资约束的延缓作用随着市场不确定性的增加而逐渐明显；相反，随着技术不确定性的增加，延缓作用逐渐减弱。再者，考虑股东和债权人间的代理冲突，构建同时分析“投资不足”和“过度投资”两种非效率投资行为的、统一的实物期权模型。在分别考察两种非效率投资行为形成机理的基础上，发现新旧债务比例可以作为非效率投资行为的一种辨别条件。而且，市场和技术两类不确定性都会减轻非效率投资的严重程度；然而，市场不确定性减轻“投资不足”的作用更为明显，而技术不确定性更加能够减轻“过度投资”。最后，考虑内部现金流随机波动和内外部融资差异导致投资资金受限的可能，考察决定企业内外部融资能力的基础变量对技术创新投资决策和投资策略选择的影响。研究结果表明：投资资金受限会激励企业尽早投资；而决定外部融资能力的基础变量对投资决策影响作用的结论可以从理论上解释现实中企业的某些投资行为和关于这些投资行为的实证结果。此外，市场不确定性越高，企业越倾向于选择等待投资策略；相反，技术不确定越高，企业越倾向于选择立即投资策略。