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线粒体DNA是研究鸟类分子进化的理想的分子标记,鸟类线粒体DNA的研究在种群遗传学和进化遗传学方面越来越显示出重要的作用.本研究分别采用PCR和质粒克隆测序方法首次对鸻形目(Charadriiformes)4科10属16种鸟类-蒙古沙鸻(Charadrius.mongolus)、环颈鸻(Charadrius.alexandrinus)、灰斑鸻(Pluvialis.squatarola)、大杓鹬(Numenius.madagascariensis)、白腰杓鹬(Numenius.arquata)、中杓鹬(Numenius.phaeopus)、红脚鹬(Tringatotanus)、林鹬(Tringa.glareola)、青脚鹬(Tringa.nabularia)、翘嘴鹬(Xenus.cineres)、翻石鹬(Arenaria.interpres)、斑尾塍鹬(Limosa.lapponica)、大滨鹬(Calidris.tenuirostris)、尖尾滨鹬(Calidris.acuminata)、反嘴鹬(Recurvirostra.avosetts)和砺鹬(Haematopus.ostralegus)线粒体DNA细胞色素b基因和NADH脱氢酶亚基6基因序列进行测定,用Clustal X 1.8软件比对并用MEGA2.1软件分析其碱基组成及变异情况,以白鹳(Ciconia ciconia)的同源序列作为外群构建分子系统树.经对位排列后,鸻形目鸟类线粒体细胞色素b基因全序列均包括1143个碱基,含381个变异位点,种间序列差异值为5.16％-16.01％;ND6基因全序列均包括522个碱基,含216个变异位点,种间序列差异值为5.17％~19.92％,两个基因均未见有插入和(或)缺失.基于Cyt b基因和ND6基因全序列分别重建的系统树都将鸻形目鸟类聚为2支:第一支为鹬类;第二支为鸻类.序列差异表明:鹬科中的塍鹬属、鸻科中的斑鸻属应提升为亚科分类阶元;鹬科鸟类种属间的系统进化关系与形态学研究结果相吻合;反嘴鹬和砺鹬与鸻科鸟类亲缘关系较近,组成一个单系群,提示将反嘴鹬和砺鹬作为一个亚科即反嘴鹬亚科归属于鸻科下属的一个类群更为合理,与核型研究结果及Sibley新分类体系的观点相一致.