在全球范围内减少二氧化碳排放,遏制温室效应蔓延,应对人类生存环境恶化,已成为世界各国的共识。随着我国“碳达峰”、“碳中和”双碳目标的提出,在社会发展进程中,如何引导供应链企业转变传统发展模式,走绿色可持续发展道路,如何有效协调供应链企业生产过程,减少碳排放对环境的不利影响,以及如何有效组织供应链企业开展长期合作减排活动,已成为供应链企业发展过程中面临的重要课题。因此,探讨政府参与协调控制下的供应链长期合作减排问题,分析政府实施差异化补贴措施下,不同合作减排模式及各参与主体行为策略的选择对供应链企业长期合作减排的影响,以期激励供应链各企业发挥自身优势,积极参与长期合作减排,实现绿色低碳和可持续发展的宏伟目标,具有非常重要的意义。本文基于供应链合作减排相关文献的梳理与总结,结合现阶段企业生产运营中的实际情况,采用微分博弈理论,考虑到政府差异化补贴对供应链企业长期合作减排的影响、产品减排量对需求的双重影响,构建了分散决策、集中决策和成本分担契约三种模式下的微分博弈模型,研究政府差异化补贴下供应链长期合作减排的动态优化问题,探究不同模式下各参与主体行为策略对供应链企业长期合作减排的影响,同时,分析政府差异化补贴措施如何引导供应链企业积极参与合作减排,政府差异化补贴措施下的成本分担契约协调机制如何实现供应链企业合作减排的完美协调优化,以及两项措施如何协调实施才能够更好地实现供应链企业长期合作减排。研究发现:在政府实施差异补贴情境下,通过成本分担契约的协调,在减少供应商和零售商低碳减排压力的同时,能够将制造商碳减排意识转移给两成员企业,改变其行为策略选择,使两企业愿意投入更多成本积极参与合作减排。政府差异化补贴和成本分担契约两项措施的协调配合实施,能够实现供应链企业长期合作减排的完美优化与协调,使成本分担契约模式下的供应链整体收益和产品减排量均达到集中决策下的水平,实现各企业最优价值的帕累托改善。政府在不同模式下的补贴力度需保持合理差异,才能使政府差异化补贴措施发挥最佳效用,也是保证成本分担契约能够实现供应链完美协调优化、推动成员企业维持长期合作减排的关键。供应商和零售商边际利润存在一定差异,是保证供应链企业达到最佳合作减排状态的必要条件。为早日实现双碳目标,需在政府宏观调控下,利用契约协调机制加强企业合作交流,促使各企业发挥自身优势,推动产业变革,走绿色低碳发展新道路。