用cDNA芯片从热休克转录因子1（heat shock transcription factor 1，HSF1）基因敲除小鼠心肌组织中筛选热休克反应中受HSF1调控的靶基因，并对筛选到的未知基因进行分子克隆。方法：①用cDNA芯片检测热休克反应（42℃ 15分钟，恢复3小时）中HSF1^-/-小鼠心肌组织基因表达谱的改变(以HSF1^+/+小鼠为对照)；②用RT-PCR对cDNA芯片筛选结果进行验证；③对差异表达的已命名基因进行启动子区HSF1结合位点的分析；④利用生物信息学方法对筛选到的未知基因进行分子克隆。结果：①共筛选到差异表达基因1142个；其中在HSF1^-/-小鼠心肌中表达下调的基因为398个，已命名基因为173个；在HSF1^-/-小鼠心肌中表达上调的基因为641个，已命名基因为235个。②在HSF1^-/-小鼠心肌中表达下调2.5倍的已命名基因中，有5个基因启动子区含有热休克元件（heat shock element，HSE）；在HSF1^-/-小鼠心肌中表达上调2.5倍的已命名基因中，有5个基因启动子区含有HSE；③克隆并在GenBank上登录人XLHSRF-1基因（GenBank ID：AY221994）和大鼠XLHSRF-2基因（GenBank ID：AY248698）。结论：在热休克反应中，HSF1^-/-小鼠心肌中多个基因表达发生改变；在这些差异表达基因中，有10个基因启动子区含HSE元件，可能受HSF1直接调控；采用生物信息学方法，克隆了两个新的应激相关基因，为进一步研究这些基因的功能及其在应激反应中的作用奠定了基础。