2020年我国已经取得脱贫攻坚胜利,在持续深入扶贫保障、乡村振兴的过程中,财政专项扶贫资金使用将面临越来越复杂多样化的风险,提升财政专项资金内部控制尤为迫切。而加强财政专项资金内部控制建设既是财政专项扶贫资金向乡村振兴资金改革转变的要求,也是推动财政专项扶贫资金预算绩效管理体系建立的重要途径。随着《关于全面实施预算绩效管理的意见》一文发布,我国开始全面建成预算绩效管理体系,财政资金使用更加注重绩效,绩效评价成为财政资金重要的内部监督手段,绩效目标实现程度成为财政资金内部控制是否有效的重要评价依据。本文以四川省财政专项扶贫资金——少数民族发展资金为研究对象,深入研究四川省少数民族发展资金使用和管理现状,针对四川省少数民族发展资金绩效目标实现较差的现状,结合预算绩效管理要求和财政专项资金内部控制相关理论,分析四川省少数民族发展资金内部控制存在的缺陷,研究发现四川省少数民族发展资金内部控制与绩效目标实现程度存在联系,内部控制有效性将会对绩效目标实现程度产生影响,相关制度执行不力、治理结构不完善、控制活动不到位、信息沟通存在屏障是主要内部控制问题。针对内部控制问题,本文借鉴其他地方财政专项扶贫资金内部控制建设思路和实施方案,从内部控制五个方面出发,根据预算绩效管理要求对四川省少数民族发展资金内部控制优化提出具体建议措施,认为内部控制优化后将会对预算绩效管理和绩效目标实现产生积极影响,四川省少数民族发展资金控制效果、使用绩效得到有效提升,为政府提高少数民族发展资金内部控制有效性,提高扶贫资金绩效,与乡村振兴有效衔接提供案例参考。