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目的:鉴定结核分枝杆菌“北京家族”菌株,了解“北京家族”菌株在新疆南疆地区的分布特征,并分析结核分枝杆菌“北京家族”菌株与耐药表型的相关性,为新疆地区结核病的防治和分子流行病学研究提供科学依据。方法:2009年1—6月,从新疆喀什市、和田市结核病医院和疾病预防控制中心住院及登记结核病拟诊患者的痰液中收集维吾尔族病人MTB临床分离株,2008年11月—2009年11月,从新疆石河子大学第一附属医院感染科收集的部分住院汉族病人MTB临床分离株,采用RD105缺失基因检测法鉴定“北京家族”菌株,药物敏感试验应用比例法进行。用频数和百分率进行统计学描述,统计学分析采用x2检验。结果:共收集到229株结核分枝杆菌临床分离株,采用RD105缺失基因检测法鉴定出“北京家族”菌株100株,占全部菌株的43.7%,非“北京家族”菌株129株,占全部菌株的56.3%,“北京家族”菌株在维吾尔族和汉族病例中所占的比例分别为39.5%(79/200)和72.4%(21/29)。统计学分析“北京家族”菌株在新疆地区汉族和维吾尔族病例中的分布差异有统计学意义(χ2=11.154,P=0.001<0.05)。对102株(汉族29例,维吾尔族73例)MTB临床分离株进行药物敏感试验,其中全部敏感菌株(RFP, INH, EMB, SM)90株,耐药菌株12株。“北京家族”菌株中耐药株为5株(10%),敏感株45株(90%),非“北京家族”菌株耐药株为7株(13.5%),敏感株45株(86.5%)。统计学分析两者与耐药表型的相关性,差异无统计学意义(χ2=0.294,p=0.588>0.05)。结论：结核分枝杆菌“北京家族”菌株在新疆维吾尔族人群中呈一般流行趋势,而在汉族人群中为主要流行菌株。“北京家族”菌株是否为新疆地区的主要流行菌株还有待进一步研究。结核分枝杆菌“北京家族”菌株与耐药表型无明显相关。