SCN1A基因截短突变患者的临床分析及截短突变诱导的NMD机制研究

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【研究目的】本研究选取Dravet综合征(DS)患者SCN1A基因不同位置的截短突变位点,分析相应患者的临床特点,通过构建相关minigene,进行无意义密码子介导的mRNA降解(NMD)机制研究,以探讨在SCN1A基因上不同位置的截短突变能否激发NMD机制,以及研究NMD与临床表型的关系。【研究方法】通过详细收集携带SCN1A基因截短突变的Dravet综合征(DS)患者的临床资料及突变特点,构建融合表达绿色荧光蛋白(GFP)和SCN1A基因截短突变的minigene。通过鉴定不同细胞系内源性抗性基因Kana基因的表达,从而选取无Kana基因表达的人宫颈癌细胞(Hela细胞)、人类神经母细胞瘤株细胞(SH-SY5Y细胞)、NGF诱导的褐家鼠肾上腺嗜铬细胞瘤细胞(NGF诱导的PC12细胞)作为转染对象,通过脂质体法转染技术,将野生型质粒及截短突变质粒分别转染入上述三种细胞,提取总RNA,经反转录得cDNA,以cDNA为模板,Kana基因及GAPDH基因为内参,进行荧光定量PCR(QPCR)。比较SCN1A基因的野生型及截短突变型质粒在三种细胞中的mRNA相对表达量,每组实验重复三次获得均值。相对定量数据处理采用2-△△Ct法,计量资料以均数±标准差(X±S)表示,采用SPSS l7.0软件包进行统计分析,单因素多样本均数比较采用ANOVA分析,P<0.05为差异具有统计学意义。【结果】1.临床资料分析携带c.4526delA,c.4547C>A,c.52805281delTG, c.56215622delGG截短突变位点的患者均诊断为SMEI,携带c.5540-5541insCCAG突变位点的患者诊断为SMEB,无肌阵挛发作类型,其中携带c.5540-5541insCCAG,c.56215622delGG的患者符合孤独症诊断,c.5540-5541insCCAG患者孤独症儿童行为量表(简称ABC量表)78分,儿童孤独症评定量表(简称CARS量表)36分,c.56215622delGG患者ABC量表110分,CARS量表41分。2.PEGFP-C2-SCN1A–minigene野生型及突变型质粒构建和鉴定将表达绿色荧光蛋白及SCN1A基因24至26号外显子的DNA片段(包含25号内含子)连接到PEGFP-C2载体。PEGFP-C2-SCN1A-minigene质粒测序24至26号外显子基因编码区未发现突变,得到野生型minigene,并构建c.4526delA, c.4547C>A, c.52805281delTG, c.5540-5541insCCAG,c.56215622delGG突变型minigene。3.四种细胞系内源性Kana基因表达鉴定HEK293细胞有内源性Kana基因表达,而NGF诱导的PC12细胞,Hela细胞,SH-SY5Y细胞均无內源Kana基因表达。4.荧光定量PCR以Kana基因作为内参基因,Hela细胞中野生型与突变型c.4526delA,c.4547C>A, c.52805281delTG, c.5540-5541insCCAG, c.56215622delGGSCN1A基因mRNA相对表达量分别为1.034±0.337,0.843±0.059(p>0.05),0.898±0.063(p>0.05),1.001±0.184(p>0.05),0.804±0.149(p>0.05),0.784±0.041(p>0.05);SH-SY5Y细胞中野生型与突变型c.4526delA,c.4547C>A,c.52805281delTG,c.5540-5541insCCAG,c.56215622delGG SCN1A基因mRNA相对表达量分别为1.001±0.073,1.046±0.045(p>0.05),1.078±0.01(p>0.05),1.057±0.037(p>0.05),1.051±0.029(p>0.05),1.204±0.088(p>0.05);NGF诱导的PC12细胞中野生型与突变型c.4526delA,c.4547C>A,c.52805281delTG,c.5540-5541insCCAG, c.56215622delGG SCN1A基因mRNA相对表达量分别1.01±0.174,0.67±0.118(p<0.05),0.665±0.067(p<0.05),0.684±0.102(p<0.05),0.934±0.046(p>0.05),0.634±0.084(p<0.05);以GAPDH基因为内参基因,NGF诱导的PC12细胞中野生型与突变型c.4547C>A,c.52805281delTG,c.5540-5541insCCAG, c.56215622delGG SCN1A基因mRNA相对表达量分别1.014±0.173,0.079±0.02(p<0.05),0.3±0.072(p<0.05),0.299±0.075(p<0.05),0.232±0.034(p<0.05)。【结论】1.携带SCN1A基因不同位置的截短突变患者临床症状不完全相同;2.SCN1A基因截短突变所诱发的NMD机制在不同细胞系中表现不同;3.在NGF诱导的PC12细胞中不同位置的截短突变所诱发的mRNA降解量不同,推测可能存在更复杂的机制影响SCN1A基因的表达。
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