茄子SOD基因的克隆与表达分析

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本实验选取紫茄品种‘禾线’为实验材料,采用同源克隆的方法首次从茄子中获得三个与抗逆相关的SmSOD基因,分别命名为SmMnSOD、SmCu/ZnSOD和SmFeSOD。对基因序列进行生物信息学分析,SmMnSOD含有一个大小为687bp开放阅读框(ORF),编码一个由228个氨基酸残基组成的MnSOD,分子量约是25.63kDa,与辣椒和番茄的MnSOD基因序列同源性分别达到91%和84%;SmCu/ZnSOD的开放阅读框含为459bp,编码一个15.25kDa由152个氨基酸残基组成的Cu/ZnSOD蛋白。多基因序列比对发现SmCu/ZnSOD与马铃薯和番茄Cu/ZnSOD相似性分别达到95%和94%;SmFeSOD的包含一个720bp大小的ORF,编码一个25.63kDa左右由239个氨基酸残基组成的FeSOD蛋白。序列比对发现SmFeSOD与烟草和番茄的FeSOD序列同源性分别达到93%和90%。对3个SmSOD蛋白构建系统进化树和高级结构模型,确定了茄子中三种SOD与其他物种中同类SOD在进化上的关系。亚细胞定位表明SmMnSOD蛋白定位于线粒体,SmCu/ZnSOD蛋白定位于细胞核和细胞质的质膜附近,而SmFeSOD蛋白定位于叶绿体。组织表达特异性分析发现SmMnSOD、SmCu/ZnSOD和SmFeSOD均具有组成型表达特点,在茄子6种组织中都有表达,但表达水平存在差异。SmMnSOD在茄子叶片中表达量最高,根和花瓣中次之;SmCu/ZnSOD在茄子花瓣中的表达量显著高于其他组织;SmFeSOD则在茄子叶片中拥有最高的表达水平。对不同胁迫下SOD的总酶活进行分析,发现SmSOD在茄子抵御盐胁迫、低温胁迫以及外源脱落酸影响方面发挥着积极的作用。NaCl胁迫下,SOD总酶活性提升最高,且高活性水平能维持更长的时间,其次为低温和脱落酸。PEG胁迫虽可小幅度提升SOD活性但影响甚微。三个SmSOD基因在应对不同胁迫时,相互之间具有独立性,通过协作提高茄子中SOD的活性来增强植株对ROS的清除能力,进而提升茄子的整体抗逆性。SmMnSOD、SmCu/ZnSOD和SmFeSOD在NaCl胁迫下表达量均得到快速地上调,低温胁迫能轻微上调SmCu/ZnSOD和SmFeSOD的表达,而显著抑制SmMnSOD的表达。SmMnSOD和SmCu/ZnSOD在PEG胁迫下,表达量起初下降进而上升,SmFeSOD则表现出较大波动性。外源ABA处理茄子幼苗后,SmMnSOD、SmCu/ZnSOD和SmFeSOD表达量均呈现出波动变化的状态。
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