莱姆病是一种由蜱叮咬而传播的人兽共患病。其病原体伯氏疏螺旋体,又称莱姆病螺旋体。最初该病原体被认为是一个同质的群体。随着病原学研究的深入,逐步证实不同来源的莱姆病螺旋体菌株间存在相当大的遗传异质性。到目前为止,全球莱姆病螺旋体至少可分为14个基因型：狭义伯氏疏螺旋体(B. burgdorferi sensu stricto)、伽氏疏螺旋体(B. garinii)、阿弗西尼疏螺旋体(B. afzelii)、日本疏螺旋体(B.japonica)、法雷斯疏螺旋体(B. valaisiana)、卢西塔尼疏螺旋体(B. lusitaniae)、安德森疏螺旋体(B. andersonii)、塔卢基疏螺旋体(5. tanukii)、土德疏螺旋体(B. turdi)、比塞蒂疏螺旋体(B. bissettii)、西尼伽疏螺旋体(B. sinica)、斯柏曼疏螺旋体(B. spielmani)、哈里弗疏螺旋体(B. californiensis)和卡罗琳疏螺旋体(B. carolinensis sp.Nov)。并且新的基因型不断出现。莱姆病螺旋体基因型的分布与地理环境、媒介生物、宿主动物等有密切关系,不同基因型引起的主要临床疾病也有所不同。所以研究中国莱姆病螺旋体的遗传多态性、基因型分类及其分布情况对莱姆病流行病学研究和莱姆病的防治都有重要意义。本研究采用多位点序列分析的方法,选用rrf-rrl spacer、rrs、hbb、groEL、recA、fla和ospA共7个位点,对102株来源于12省(市、自治区)的蜱、啮齿动物和病人的中国莱姆病螺旋体分离株进行了PCR扩增和测序。采用MEGA4.0软件对102株中国菌株和8株国际参考菌株的序列进行聚类分析,结合5S-23SrRNA基因间隔区PCR-RFLP分析的结果,对中国莱姆病螺旋体的遗传多态性、基因型及其在不同地区的分布、与媒介和宿主动物的关系进行了研究。结果表明,本次研究选用的102株国内莱姆病螺旋体分离株共分为4个型：狭义伯氏疏螺旋体、伽氏疏螺旋体、阿弗西尼疏螺旋体和法雷斯疏螺旋体,其中67株(65.69%)为伽氏疏螺旋体,分布在黑龙江、吉林、辽宁、内蒙古、新疆、河北和广东；20株菌(19.61%)为阿弗西尼疏螺旋体,分布在黑龙江、吉林、辽宁、新疆、山东、北京、重庆、广东和贵州；14株菌(13.73%)为法雷斯疏螺旋体,分布在贵州；1株菌为狭义伯氏疏螺旋体,分布在湖南。在三种致病基因型中,伽氏疏螺旋体和阿弗西尼疏螺旋体是我国的主要致病基因型,狭义伯氏疏螺旋体在国内莱姆病的感染和致病中不占主要地位。同时我们发现在黑龙江、吉林、辽宁、新疆和广东都存在伽氏疏螺旋体和阿弗西尼疏螺旋体两种基因型的菌株,贵州存在法雷斯疏螺旋体和阿弗西尼疏螺旋体两种基因型的菌株。这说明我国莱姆病螺旋体存在明显的遗传多态性,很多省份间存在很大的遗传差异。本研究还发现作为我国北方莱姆病主要传播媒介的全沟硬蜱携带伽氏疏螺旋体和阿弗西尼疏螺旋体两种基因型菌株；法雷斯疏螺旋体的媒介主要为粒形硬蜱,分布在贵州；此外,发现长角血蜱和二棘血蜱主要携带阿弗西尼疏螺旋体基因型菌株。而且还发现黑线姬鼠为莱姆病螺旋体的重要宿主动物,可携带伽氏疏螺旋体、阿弗西尼疏螺旋体和法雷斯疏螺旋三个基因型的菌株。目前的研究发现伯氏疏螺旋体(即莱姆病螺旋体)存在高度的遗传异质性,至少含有14个基因型,其中明确对人类致病的基因型为：狭义伯氏疏螺旋体、伽氏疏螺旋体和阿弗西尼疏螺旋体。通过5S-23SrRNA基因间隔区PCR-RFLP和多位点序列分析方法确认我国至少存在四个基因型狭义伯氏疏螺旋体、伽氏疏螺旋体、阿弗西尼疏螺旋体和法雷斯疏螺旋体。为了解中国莱姆病螺旋体基因组信息、揭示种间的差异及其进化规律；同时为研究莱姆病螺旋体致病机制提供线索,我们采用基因组学技术对中国四个基因型的5株代表菌株(CS4属于狭义伯氏疏螺旋体菌株,PD91属于伽氏疏螺旋体菌株,FP1和R9属于阿弗西尼疏螺旋体菌株,Qx-S13属于法雷斯疏螺旋体菌株)进行了全基因组测序和初步分析。结果表明,中国5株伯氏疏螺旋体的染色体大小为946,464bp-1,024,390bp,G+C含量为27.66%-28.3%,5株菌的染色体功能和代谢模块分布基本相同。主要为：编码维持细胞生长、繁殖、以及细胞动力(编码鞭毛蛋白、鞭毛构体状蛋白等)、防御等成分。另有部分未知功能的基因。在染色体基因组,对5株测序菌株分别与相应基因型的国外参考菌株进行了比对,结果表明B.B.s.s 2株菌间的遗传差异最小,没有PA gene, SNP的数量也仅仅为70个；B.g 2株菌遗传差异最大,SNP数量为5917个,是B.B.s.s型内差异的85倍；B.v 2株菌间的差异主要是具有较多的PA gene。对测序菌株质粒进行了分析,结果表明5株菌的质粒存在较大差异,但均含有cp26和lp54或与其同源的质粒。