改革开放以来，我国农村建设虽然取得了巨大的成就，但城乡差距越来越大，如何提高我国农村的经济发展水平一直是我国政府关心和着力解决的一个迫切问题。在提高农村综合生产能力、增加农民收入的过程中，农村集体经济组织发挥了重要作用，社区股份合作经济组织是我国农村集体经济组织的三大创造之一，是今后农村改革的方向。但随着社区股份合作经济组织逐步向市场化的过渡及在逐步建立现代企业制度的过程中，其代理成本日益严重，如何控制和降低代理成本是学者和管理者关注的重点。本文将已有的相关理论应用到一个独特的农村经济组织中，探讨其代理成本的影响因素和如何降低代理成本，提高组织绩效。 本文基于对已有研究成果的分析、总结，构建了社区股份合作经济组织的股权结构、内部治理结构、激励机制、外部社会环境等与代理成本的关系模型，提出相关假设，并以社区股份合作经济组织发展最成熟的广州市农村为样本进行了实证研究。本研究经过问卷调查，共得到有效样本300个，运用模块化神经网络的数据处理方法进行了分析，结果表明22个假设中，有6个得到支持，3个获得反向支持，13个没有得到支持。结合已有的研究成果，从多个角度对所得结果进行了分析，主要结论如下： 第一，研究结果表明，不考虑社区股份合作经济组织所承担的社会职能影响时，有非集体股的代理成本反而更高；而在加入调节变量后，在外部环境不断完善，即组织承担的社会职能越来越少时，有非集体股的社区股份合作经济组织代理成本低。这表明在外部环境市场化程度日益提高时，非集体股有了较顺畅的对经理人行使监督权的途径，具有更强的积极性与监督性，能较好地控制代理成本。 第二，股东代表大会每年召开的次数与代理成本负相关。 第三，董事会规模与代理成本正相关，董事会成员平均学历与代理成本负相关，董事会每年召开的次数与代理成本负相关。 第四，由于农村社区股份合作经济组织有其独特的政治性，党委在组织的运行中发挥了重大的作用，本文在研究社区股份合作经济组织的内部治理结构时增加了党委这一变量。结果表明，党委成员平均学历与代理成本负相关。 第五，在社区股份合作经济组织中，一些内部的治理结构，如董事会、股东代表大会和党委对监督经理人的行为，控制代理成本发挥了一定的作用，但这种作用需要合适的外部政策环境相配合。目前的社区股份合作经济组织外部政策环境还存在不完善和有待改进的地方，内部治理结构在社区股份合作经济组织中的监督作用有限。 本文基于上述的结论提出了相关的政策建议，将为我国政府改进农村社区股份合作经济组织的管理方法，社区股份合作经济组织采取措施降低代理成本提供有益的指导和借鉴。