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水库是福建省重要的饮用水资源,它们对民生有着不言而喻的重要性。本研究于2010年首次对福建的坂头水库、汀溪水库、山仔水库的浮游植物和环境因子进行了周年调查和比对,同时将三座水库的浮游植物群落结构与浅水型湖泊(巢湖)进行比对,进而阐明浮游植物在水库与湖泊富营养化进程中如何变化及响应,为浮游植物生态学研究提供依据。坂头水库共检出藻类7门74属127种,汀溪水库共检出藻类7门70属120种,山仔水库共检出6门33属48种。主要的优势种类分别为：坂头水库—拉氏拟柱孢藻(Cylindrospermopsis raciborskii),汀溪水库—伪鱼腥藻(Pseudanabaena catenata)和依沙束丝藻(Aphanizomenon issatschenkoi.),山仔水库—凯氏鱼腥藻(Anabaena kisseleviana)、铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa)和伪鱼腥藻(Pseudanabaena mucicola)。三个水库年平均藻密度分别为307.99 X 106cell/L,19.61 X 1O6 cell/L、84.58×106 cell/L。巢湖共检出浮游植物7门,82属,163种。主要优势种为水华鱼腥藻(Anabaena flos-aquae)、水华束丝藻(Aphanizomenon fios-aquae)、铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa)、惠氏微囊藻(Microcystis wesenbergii)、绿色微囊藻(Microcystis viridis)伪鱼腥藻(Pseudanabaena mucicola)、游丝藻(Planctonema lauterbornii)、以及梅尼小环藻(Cyclotella meneghiniana),群落结构复杂。年平均总藻密度为129.2×106 cell/L。综合Shannon-Weaver多样性指数、Pielou均匀度指数、丰度指数分析表明三座水库的富营养化程度为坂头>山仔>汀溪。其中,坂头水库和山仔水库为重富营养状态,汀溪水库为中富营养状态。三座水库除了坂头水库外,优势种出现的时期较短,爆发水平较低。而巢湖常年群落结构较复杂,优势蓝藻再现的频率较高,分布较广比对分析了福建三座水库的水质因子的周年变化,并结合canoco4.5软件进一步用RDA和CCA分析环境因子与物种之间的关系,结果表明坂头的拟柱孢藻与COD的相关性最大；汀溪的伪鱼腥藻和依沙束丝藻的演替可能与总氮的变化相关,且依沙束丝藻与温度也显著相关性；山仔水库凯氏鱼腥藻则与溶解氧的相关性最大,其次为TP,伪鱼腥藻(Pseudanabaena mucicola)与N/P和SD的相关性最大,但铜绿微囊藻则与温度的相关性最大。研究表明山仔水库和巢湖的伪鱼腥藻与微囊藻属的出现存在显著的相关性,并且与铜绿微囊藻和惠氏微囊藻的相关最大。水华鱼腥藻已经成为巢湖全年分布的优势种。