我国是生产和消费猪肉量最大的国家,猪肉是我国居民消费的最主要肉类产品,对其建立有效的溯源系统,更是迫在眉睫。随着当代高通量测序技术的发展,DNA标记已经逐渐被用于肉类产品的溯源系统建立。在DNA标记中, SNP(Single Nucleotide Polymorphisms)标记,以其相对简单且检测成本较低,是一种可有效对猪肉产品进行溯源的遗传学方法。为种猪档案库建设所需,本研究选用我国最常用的商品猪种洛克、长白和大约克猪,对杜洛克、长白和大约克猪个体身份的DNA识别进行了研究。并提供了一种新的遗传标记——“多位点合并基因型DNA片段”,用于猪个体身份识别及其产品的溯源。一、为了更多地挖掘可用于猪个体识别的SNP,共筛选了8对引物,PCR扩增后将产物直接测序,得到了63个SNP。取杂合度≥0.10的SNP,这些SNP在不同品种中所组成的基因型数目不同,最终可用于实验中三个品种溯源的SNP,在杜洛克中有16个,在长白中13有个,在大约克中有17个,可组成131220(杜洛克)、2160(长白)、6480(大约克)种基因型。以这些SNP为基础的基因分型策略,足以应用到饲养杜洛克猪的猪场进行猪肉产品的个体识别或溯源。对于其他猪种,则需要获得更多的SNP才能够实现。二、为了检测出足够可用的SNP,提出了“多位点合并基因型DNA片段筛选”的方法,寻找可用于猪个体身份识别及其产品溯源的SNP。“多位点合并基因型DNA片段”较其他DNA标记包含更多的SNP,产生更多不同的基因型,更有利于溯源及个体鉴定。实验中,共设计了76对引物,其中54对引物扩增出了“多位点合并基因型DNA片段”,可见“多位点合并基因型DNA片段”的获得率接近80%。通过这样的方法,可以更有效获得包含多SNP的DNA片段,以这些片段为遗传标记将是猪个体识别及产品溯源的一种有效工具。