【摘 要】
：
为了更好的了解番茄种质资源的遗传多样性,解决宁夏地区番茄种质资源遗传变异重复率高,利用效率低,优良品种选育难度高等问题。本研究运用KASP技术,利用筛选出分布于12条染色体的60对多态性较高的SNP引物,对收集的504份番茄种质资源进行遗传多样性分析、聚类分析、主成分分析及群体结构分析;以60对SNP引物对504份番茄的分型结果为基础,设置4个抽样比例（20%、15%、10%、5%）,利用Core
【基金项目】
：
宁夏回族自治区农业特色优势产业育种专项（NXNYYZ20200104）； 宁夏回族自治区重点研发计划（重大）重点项目（2019BBF02022）；
论文部分内容阅读
为了更好的了解番茄种质资源的遗传多样性,解决宁夏地区番茄种质资源遗传变异重复率高,利用效率低,优良品种选育难度高等问题。本研究运用KASP技术,利用筛选出分布于12条染色体的60对多态性较高的SNP引物,对收集的504份番茄种质资源进行遗传多样性分析、聚类分析、主成分分析及群体结构分析;以60对SNP引物对504份番茄的分型结果为基础,设置4个抽样比例（20%、15%、10%、5%）,利用Corehunter软件进行核心种质的构建,通过t检验比较不同抽样比例构建的核心种质与原始种质的遗传参数（等位基因数、Shannon’s信息指数、多态性信息值、基因多样性）的差异性,确定最佳的抽样比例,利用GeneAIEx软件基于遗传距离对最佳抽样比例构建的番茄核心种质和原始种质进行主成分分析,判断最佳抽样比例构建核心种质的代表性和合理性;对最佳抽样比例构建的核心种质进行番茄白粉病室内苗期的抗病性鉴定,结合筛选的覆盖番茄全基因组的60个SNP分子标记利用混合线性模型MLM（Q+K）进行全基因组关联分析。主要研究结果如下:1.基于SNP标记的番茄种质资源遗传多样性分析:60个SNP分子标记共检测到181个等位基因,平均每个位点有3个等位基因,SNP标记的主要等位基因频率平均值为0.659,变幅为0.375～0.905,其中NDP7560最高,NDP7781最低;基因多样性在0.178-0.658之间,平均值为0.45;多态性信息值（PIC）变化范围 0.171～0.583,平均值为 0.381,NDP7723（0.554）、NDP7589（0.501）、NDP7529（0.551）、NDP7710（0.508）、DNP7625（0.577）、NDP7596（0.569）、DNP7661（0.537）、NDP7368（0.512）、DNP7781（0.583）共 9 个高度多态性的 SNP 标记;距离计算结果可知,各材料间的平均遗传距离为0.62;在遗传距离为0.36时,504份番茄材料划分为7个类群,第Ⅰ类包括2份材料,第Ⅱ类包括120份材料,第Ⅲ类包含8份材料,第Ⅳ类别包括72份材料,第V类和第Ⅵ类均包括2份材料,第Ⅶ类包含298份材料;主成分分析将群体分为三个类群;群体结构分析,在K=3时,将504份番茄种质资源划分为3类,第一类群包含79份,第二类群包含302份,第三类群包含123份。2.通过计算可得20%、15%、10%、5%四个不同取样比例下等位基因的保留比例分别为94%、96%、100%、92%,在对遗传参数进行t检验发现,平均多态性信息值PIC（20%抽样比例）、平均Shannon’s信息指数（15%抽样比例）、等位基因数（5%抽样比例）与原始种质存在显著差异（a=0.05）,在10%抽样比例时,构建50份核心种质的基因多样性、等位基因数量、Shannon’s信息指数、等位基因保留率分别为45.5、181、1.23、100%,与原始种质各遗传参数在0.05水平无显著差异,确定10%的最佳抽样比例;对最佳抽样构建的番茄核心种质和原始种质进行主坐标分析,结果显示核心种质在整个番茄种质资源中均匀分布,聚类分析将50份核心种质划分为5类,第1类1份材料,第2类18份材料,第3类7份材料,第4类11份材料,第5类有13材料,均匀分布在原始种质聚类的第Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅶ类群中,表明本研究在最佳就抽样比例为10%时所构建的50份番茄核心种质具有代表性,能够代替原始种质的遗传信息。3.对上述构建的核心种质进行番茄室内苗期白粉病抗病性鉴定,其中表现为中抗的有9份材料,为感病的有33份材料,极感的有8份材料,无免疫和抗病材料,结合前期筛选的60个SNP标记进行GWAS分析,检测到一个与番茄白粉病关联的SNP位点,对表型的贡献率为32.89%,通过SGN查找发现,预测基因SL2.50Ch02.path1.gene2036,位于关联标记下游位置。本研究结果可为下一步宁夏番茄的遗传育种、种质资源的收集、发掘以及核心种质构建提供理论和材料基础,且进一步说明了 SNP标记可作为番茄种质资源亲缘关系和指导亲本选配的有效工具,通过对番茄白粉病的全基因组关联分析,可为后续白粉病精准表型鉴定和基因功能的验证与开发奠定良好的基础。
其他文献
兰州百合是国家卫生部批准的首批药食兼用的植物,深受广大人民的喜爱,在国内外享有很高的知名度。近年来,我国百合种植因土地肥力的下降,使其产量和质量下降,已成为目前我国百合生产中急需解决的问题。科学有效地利用肥料,是调整土壤养分平衡、提高百合鳞茎产量和质量的关键。本研究利用Hoagland营养液灌溉技术,通过固定N素和P素,调节K素单因子,探讨了兰州百合鳞茎中多酚类物质的含量、抗氧化活性以及多酚类代谢
芹菜一种不耐连作的伞形科植物,由于宁夏冷凉地区耕地面积有限、施肥措施单一、种植条件制约及一味追求经济利益等因素,致使芹菜多年重茬已成为当地农业生产中常采用的种植方式,出现连作障碍。本试验采用大田定位试验,以连作4年的芹菜地为研究单元,共设置5个处理:常规施肥（CK）,常规施肥+有机肥（OF）,常规施肥+蚯蚓粪肥（VC）,常规施肥+生物炭（BC）,常规施肥+黄腐酸钾（FK）,研究不同施肥措施对连作芹
葡萄蒸馏酒以其独特的果香、类似白酒的口感而展现出良好的市场前景。针对葡萄蒸馏酒生产过程中脱硫、掐头去尾、蒸馏原料及工艺、催陈方法等技术存在的问题开展研究。本文以理化指标、挥发性香气成分和感官品评为依据,探究不同蒸馏工艺和人工催陈技术对葡萄蒸馏酒品质的影响,旨在为提高葡萄蒸馏酒品质、提高生产效率提供技术支持。主要研究结果如下:1.对比研究了氧化氢法和氧化钙法对葡萄原酒中SO2脱除的效果。过氧化氢法用
以6年生抗寒葡萄‘北红’高接‘西拉’葡萄所获一年生枝条为试材,研究了越冬期间不同保温材料包裹对‘西拉’葡萄一年生枝条表面温湿度、总含水量、抗逆生理指标和越冬后枝条成活率的影响,旨在筛选出有利于‘西拉’葡萄安全越冬的保温材料,为酿酒葡萄免埋土越冬提供理论依据和技术措施。本试验以传统温棚保温被为CK,不同保温材料进行组合设为六个处理,分别为:T1黑色牛津布+240g/m2化纤棉+双层塑料膜+黑色牛津布
随着现代生活的变化,人们对于蝴蝶兰的欣赏逐渐青睐于微型、小花、双梗品类,并逐步成为蝴蝶兰市场的主流。本试验以3个品种微型双梗蝴蝶兰为试材。研究了继代试管苗在不同激素浓度配比、不同活性炭浓度处理及不同红蓝光质配比下,试管苗的生长及增殖状况,并比较了品种间对各处理的反应,从而优化了各品种试管苗高效增殖体系。同时开展了对微型蝴蝶兰抽生双梗及生长所需栽培条件的研究。最后,针对低温催梗,比较了低温条件下各品
兰州百合（Lilium davidii var.unicolor）作为中国可食用百合品系中的甜百合,是国家卫生部首批审批通过的药食兼用的植物,其经济价值以及药用价值十分可观,鳞茎作为主要的食用部位,富含多糖等活性成分,具有重要的功能特性,可参与生物体的免疫调节功能、抗氧化等。因此,改善兰州百合农艺性状指标,提高植株各器官多糖的含量,是增加百合产量,提升百合食用品质和药用品质的重要途径。本试验以兰州
本研究以宁夏贺兰山东麓6年生的免埋土的3个红色酿酒葡萄品种为研究对象,采用荧光定量PCR技术对3个品种植株的新梢、嫩叶、老叶、叶柄、枝蔓、根等部位进行病毒监测,探究适合‘北玺’、‘北香’、‘北馨’三个品种的组培快繁体系,并筛选适宜的脱毒处理方法,主要研究结果如下:1.检测了 12种常见病毒在‘北玺’、‘北香’、‘北馨’三个品种不同部位的病毒感染情况,三个品种共检测出10种病毒,其中‘北香’中检测出
本文以3年生黑果腺肋花楸实生苗为实验对象,本试验于2021年3月15日移栽至11月15日落叶结束。黑果腺肋花楸的整个生长发育期可划分为萌芽展叶期（4月10日-5月09日）、开花坐果期（5月10 日-6月15日）、果实膨大期（6月16日-8月31日）、果实成熟期（9月1日-10月31日）和落叶期（1 1月1日-12月1日）共五个生长发育时期。本实验主要以前四个时期为主,以不同水分处理下盆栽黑果腺肋花
为了探究宁夏酿酒葡萄的品质,提升其所酿的葡萄酒品质,本研究选择‘北红’和‘赤霞珠’两种葡萄品种,在两个葡萄品种的转色期后,分别设置不同土壤温度（覆膜处理）和相对含水量的种植环境（共4种处理和空白对照）,最终测定葡萄果实和葡萄酒相对应的指标来反映果实品质和葡萄酒品质,同时探究不同处理对两者品质的影响。4种处理分别是:T1（有覆膜,土壤相对含水量为60%-70%）、T2（无覆膜,土壤相对含水量为60%
为了确定宁夏西瓜枯萎病尖孢镰孢菌西瓜专化型（Fusarium oxysporumf sp.niveum）生理小种分化及西瓜枯萎病生理小种2抗病基因定位,利用分子生物学鉴定、鉴别寄主鉴定和GWAS方法对分离自宁夏的枯萎病菌株和西瓜种质进行研究。研究结果如下:（1）从11个商业西瓜田中获得的84个分离菌株都是镰孢菌（Fusarium oxysporum）,其中23株为尖孢镰孢菌西瓜专化型（Fusari