【摘 要】
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目的:通过GEO和Oncomine数据库进行生物信息学分析,同时结合实验方法验证,探究GATA3、BCL11B及CDKN2A在外周T细胞淋巴瘤（peripheral T-cell lymphoma,PTCL）中的差异性表达,分析GATA3、BCL11B和CDKN2A在PTCL与反应增生性淋巴结中表达水平的差异与临床危险因素及预后评估的意义,以期指导PTCL的精准分类、早期诊断及个性化治疗。方法:1
【基金项目】
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山西医科大学分子影像精准诊疗协同创新中心开放基金资助项目（编号:2020-MS02）；
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目的:通过GEO和Oncomine数据库进行生物信息学分析,同时结合实验方法验证,探究GATA3、BCL11B及CDKN2A在外周T细胞淋巴瘤（peripheral T-cell lymphoma,PTCL）中的差异性表达,分析GATA3、BCL11B和CDKN2A在PTCL与反应增生性淋巴结中表达水平的差异与临床危险因素及预后评估的意义,以期指导PTCL的精准分类、早期诊断及个性化治疗。方法:1.利用GEO和Oncomine数据库分析GATA3、BCL11B及CDKN2A m RNA在PTCL组织中的表达情况及三者的相关性。2.收集山西省肿瘤医院2010年1月至2020年5月间诊断为PTCL的123例患者病例资料及石蜡标本（具有完整的临床病程资料及随访记录）作为实验组,随机选取40例反应性增生性淋巴结（lymph node reactive hyperplasia,LH）作为对照组,制作组织芯片,采用免疫组织化学染色方法（immunohistochemistry,IHC）检测GATA3、BCL11B及CDKN2A蛋白在实验组和对照组中的表达水平。3.采用逆转录聚合酶链反应（reverse transcriptase polymerase chain reaction,RT-PCR）方法检测80例PTCL及40例LH石蜡组织标本中GATA3、BCL11B与CDKN2A m RNA的表达情况。4.应用统计学软件SPSS25.0,分析GATA3、BCL11B及CDKN2A蛋白及m RNA在实验组和对照组中的差异性表达,并分析三者之间的相关性,其表达与PTCL疾病各病理因素之间的联系。使用绘图软件Graph Pad Prism 8.0进行制图。结果:1.数据库分析结果:GEO数据库中根据数据集GSE132550分析得出,GATA3和BCL11B在PTCL病例中的转录水平低于正常T细胞,而CDKN2A在PTCL病例中的转录水平高于正常T细胞（P＜0.05）。Oncomine数据库表明,GATA3和BCL11B基因表达具有相关性。2.IHC结果:GATA3和BCL11B阳性均定位于细胞核,在PTCL组织中阳性表达率分别为60.98%（75/123）和56.10%（69/123）,而在LH组织中阳性率分别为85.00%（34/40）和75.00%（30/40）,GATA3和BCL11B蛋白表达在两种组织中差异具有统计学意义（P＜0.05）。CDKN2A蛋白在细胞质/核内堆积,PTCL组织中阳性率为79.67%（98/123）,在对照组LH组织中阳性率为70.00%（28/40）,差异无统计学意义（P＞0.05）。3.RT-PCR结果:80例PTCL中GATA3和BCL11B m RNA相对表达量均低于对照组（分别为0.678比1.855、0.702比1.832）,差异有统计学意义（P＜0.05）。CDKN2A m RNA相对表达量略高于对照组（1.113比1.081）,差异无统计学意义。4.GATA3、BCL11B及CDKN2A表达与临床危险因素的联系:GATA3蛋白表达与Ann Arbor分期及病理类型相关,CDKN2A蛋白表达与病理类型相关（P均＜0.05）。5.PTCL组织中GATA3、BCL11B及CDKN2A m RNA相对表达量水平与蛋白表达水平的相关性:相关性分析结果表明,在实验组中GATA3、BCL11B及CDKN2A m RNA相对表达量水平与其蛋白表达水平均无明显相关（P＞0.05）。6.GATA3、BCL11B及CDKN2A在PTCL中表达的相关性:相关性分析结果表明,在实验组中BCL11B蛋白表达与GATA3蛋白表达呈显著正相关（r=0.357,P＜0.01）。7.PTCL中GATA3、BCL11B及CDKN2A表达的预后意义:GATA3 m RNA低表达组,总生存期较高表达组略短;BCL11B基因低表达组,总生存期较高表达组短（P均＜0.05）。BCL111b-/GATA3-组总生存期较BCL111b+/GATA3+组短（P＜0.05）。BCL11B蛋白是PTCL的独立危险预后因素。结论:通过数据库分析加实验验证方法得知,BCL11B和GATA3在PTCL与LH中存在差异性表达,且影响疾病的预后。CDKN2A的表达在PTCL与LH中不存在差异性。BCL11B和GATA3可能参与了淋巴瘤的发生和进展,这两种转录因子有望为PTCL的分型诊断及判断预后提供新的思路与方向。
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