【摘 要】
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生物测序技术发展迅速,越来越多的癌症数据信息被挖掘,基因分析方法的多样化也使得了解疾病背后的致病机理与关键突变基因成为可能,为后续开展化疗及靶向治疗等提供理论基础.基因治疗作为新兴治疗手段,可以将靶向药物精准输送至突变基因,有针对性地开展预后治疗.恶性胸膜间皮瘤隐匿性强,患者生存期短.已有研究结果显示,间皮素和纤毛蛋白-3可用于筛选生物标志物,SUV值可判定预后效果.目前双免疫治疗法将患者生存时间
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生物测序技术发展迅速,越来越多的癌症数据信息被挖掘,基因分析方法的多样化也使得了解疾病背后的致病机理与关键突变基因成为可能,为后续开展化疗及靶向治疗等提供理论基础.基因治疗作为新兴治疗手段,可以将靶向药物精准输送至突变基因,有针对性地开展预后治疗.恶性胸膜间皮瘤隐匿性强,患者生存期短.已有研究结果显示,间皮素和纤毛蛋白-3可用于筛选生物标志物,SUV值可判定预后效果.目前双免疫治疗法将患者生存时间延长至3年,但依旧无法根治疾病;疾病发病率也存在性别差异,男性发病率明显高于女性.在基因层面开展研究,能够发现疾病产生、发展的关键基因,为后续诊断、治疗提供理论支撑.本文自基因表达数据库GEO选取并下载基因数据集GSE51024和GSE163720,提取疾病发生发展的标志基因及信号通路,并进一步针对此疾病在男女发病率、术后治疗效果等方面的区别开展研究,判断此现象的出现,是否与雌激素信号基因的表达相关.首先对基因数据集GSE51024进行加权共表达网络分析,得到组内相似性高而组间差异性大的14个基因模块;之后将基因模块与健康、患病两个性状关联,筛选与疾病相关系数最高的模块,得到疾病发生发展的关键基因155个;通过差异表达分析,筛选得到差异基因共18819个,包括上调基因11158个,下调基因7661个.对筛选得到的关键基因与差异基因取交集,进行基于基因集的富集分析,结果显示G2M检查点、E2F靶标基因、有丝分裂纺锥体这三个基因集被富集,是恶性胸膜间皮瘤发生发展的关键信号通路.之后对基因数据集GSE163720进行加权基因共表达网络分析,得到组内相似性高而组间相似性低的基因模块98个,将基因模块与性别关联,得到与疾病相关系数最高的模块,筛选得到与性别相关的关键基因12个.差异表达分析筛选得到差异基因共102个,包含61个上调基因,41个下调基因.经贝叶斯-T检验法等发现此数据集样本之间基因相似性较高,无需继续进行差异基因筛选.
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