一株鱼类虹彩病毒羟类固醇脱氢酶基因序列测定及其特性分析

来源 :上海水产大学 上海海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wanghuia23
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该研究是在完成一株虹彩病毒基因组(LCDV-C)DNA序列测定的基础上<[45]>,对其羟类固醇脱氢酶(HSD)DNA序列及其基因特性进行分析.主要内容分以下几个部分.一、建立格式化文库取适量病毒基因组DNA,用超声仪随机剪切DNA.切胶回收1.6kb~3.0kb的目的片段,补平后连接到载体上.将重组子转入大肠杆菌DH5 α感受态细胞中.菌液复苏后,涂布于氨苄青霉素LB固体培养板上.利用a互补原理筛选阳性克隆并进行培养,做好相应的记录,建立格式化文库.二、测序用无菌的Tip挑取白色菌斑,放入含有氨苄青霉素的LB液体培养基中培养过夜.用碱裂解法提取质粒.电泳后挑取合格的质粒进行反应,然后上机测序,得到DNA序列.三、羟类固醇脱氢酶基因的特征分析将DNA序列输入数据库中,通过Blast比较找出羟类固醇脱氢酶(HSD)DNA序列,继而用DNAStar等软件对虹彩病毒HSD DNA序列及其特性进行分析.
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