在我国实施创新驱动发展战略的背景下,我国创新进程实现重大跃升。但与此同时,区域创新不平衡问题也日益凸显,其中导致区域创新不平衡的重要原因之一是区域间存在严重的创新资源错配。我国存在的行政区域划分对经济发展造成“刚性约束”,阻碍创新资源自由流动,造成区域创新资源错配。在科技革命和产业变革的浪潮中,数字经济蓬勃兴起,成为推动社会经济高质量发展的新动能。因为数字经济具有很强的渗透性、替代性和协同性,可以推进产业结构升级,从而对区域内的创新资源配置产生重要影响。因此,探究数字经济发展水平对区域创新资源错配的具体影响对于区域在创新方面协调发展,建设创新型国家具有重要意义。本文首先梳理国内外相关文献,明确研究现状,接着构建理论分析框架,从直接影响和间接影响两方面阐述数字经济发展影响区域创新资源错配的机理。进而构建数字经济指标体系,确定测度创新资源错配的方法,对2013年-2020年30个省（市）（不含港澳台及西藏地区）的数据进行测算,分析数字经济发展水平和区域创新资源错配程度的现状。在此基础上,运用面板模型实证检验数字经济发展水平对区域创新资源错配程度的影响效果,探究在不同地理区位下存在的影响异质性,并进一步构建机制检验模型,检验数字经济发展水平是否可以通过促进产业结构升级进而影响创新资源错配。研究结果表明:（1）我国数字经济存在区域发展不平衡现象,空间上呈现“东强西弱”的分布特征;从时间趋势来看,在样本期间内各区域数字经济发展水平总体呈现上升趋势,且差距进一步凸显。（2）我国各区域创新资源均存在一定程度的错配,随着时间的推进,各地区创新资源错配程度呈现缓和趋势,但改善程度不明显。（3）数字经济发展水平能够显著改善创新资源的错配程度,并且各区域数字经济发展水平的提升均能够有效缓解创新人员错配程度,但对创新资本错配的改善存在区域异质性;（4）产业结构升级是数字经济发展水平缓解创新资源错配程度的作用路径,数字经济的发展可以显著促进产业结构升级,从而改善各区域的创新资源错配程度。