喉癌线粒体DNA D-loop区突变的检测和分析

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目的:线粒体(mitochondria)是迄今发现的唯一不依赖核基因组进行复制、转录和翻译的细胞器。近年来,线粒体DNA(mtDNA)的改变与人类肿瘤发生的关系备受关注,越来越多的研究证明mtDNA的突变与肿瘤的发生关系密切,尤以D-loop区的突变率最高。mtDNA D-loop区位于16024~576bp之间,占全部mtDNA的6%左右,主要负责调控mtDNA的转录和复制。本研究中我们通过检测与分析喉癌组织中mtDNAD-loop区突变情况,进而阐述mtDNA D-loop区的突变与喉癌发生的关系。方法:以吉林大学第二医院耳鼻咽喉头颈外科手术治疗的40名喉癌患者为研究对象,年龄在45岁-75岁之间,其中男性28例,女性12例,术中切取病人的肿瘤组织及相应的癌旁组织,总计80例标本,置于负80度冰柜冻存备用,通过提取组织标本的DNA,利用PCR扩增、产物纯化和直接测序等技术,运用美国NCBI数据库的基因序列分析软件,将肿瘤组织mtDNA D-loop区序列和癌旁组织的序列与目前公认的剑桥标准序列进行比对(BLAST),找出mtDNA D-loop区的高发突变位点及高频率的多态性改变,总结并分析mtDNA D-loop区突变与喉癌发生的关系。结果:在40例喉癌患者中,有18例发生突变,突变率是45%,突变多集中在HVⅠ区,突变的类型主要表现为单个碱基的替换或单个碱基的插入和缺失,发现20个微卫星不稳定现象,主要集中在D310区,共发现多态性改变102个,单个标本最多发现多态性改变位点8个。结论:喉癌组织mtDNA突变率明显高于正常组织,喉癌mtDNA D-loop区具有高度的多态性和突变性,对mtDNA D-loop区突变的检测有望应用于肿瘤的早期诊断。
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