我国猪种资源十分丰富,现存本土猪种约占世界猪遗传资源的三分之一。同时,我国本土猪生产更加需要从生物科学角度加强对生猪育种技术的研发,以达到优化本土猪的肉质性状,由此可见养猪业是我国畜牧业中不可替代的支柱产业之一。猪肉质性状是一个复杂的综合性状,可以通过多种不同的指标来评价肉质,例如:肉色、p H值、系水力、大理石纹、肌内脂肪含量、嫩度和风味等。由于消费者在不打开包装的情况下无法评价肉的味道或者感受其肉质。因此,在这些指标中,肉色是影响消费者是否购买决策的最重要因素之一。近几年市场上因异常肉色导致经济损失达数亿美元,因此改良肉色已经成为一个亟待攻克的难题。目前测量肉色的方法有通过肉眼比色法或光学方法测定,这些测定方式与指标都还不够具体与详细,限制了肉质性状中遗传的改良。肌红蛋白（Myoglobin,Mb）是猪肉色的物质基础,不同程度的肉色取决于Mb的含量。但目前由于缺乏基因组信息,限制了对猪Mb调控机制的深入了解,且肉色遗传解析中以Mb含量为表型的研究不够充分。本实验,首次从猪高通量基因组测序的初级装配中鉴定出Mb基因的启动子序列,并通过LASAGNA预测了其潜在的98个转录因子。通过对不同猪种背最长肌m RNA表达谱的数据挖掘,构建了一个由16个适应性核心转录因子和23个次级转录因子组成的MbTFs的相互作用网络。以小型巴马香猪与大型约克夏猪作为实验动物,通过体外验证表明,巴马香猪Mb基因在m RNA和蛋白质表达水平上都显著高于约克夏猪。对Mb-TFs互作网络的q RT-PCR验证表明,FOS、STAT3、STAT1、NEFL21、NFE2L2、MAFB是巴马香猪Mb-TFs互作网络中重要的正调控核心转录因子,并且这些转录因子在巴马香猪背最长肌中表达量均显著高于约克夏猪（P（27）0.0001）。相关研究表明,mi RNA调控与肉质相关的表型包括肌纤维组成和肌内脂肪含量等因素,这些因素决定了肉色、风味、多汁性和持水性。为了进一步探索更多可能调控Mb基因相关mi RNA的机制以及它们对肉质可能存在的作用和影响,本实验采用BLAST本地化程序比对出8个mi RNA:mi R-128、mi R-9798-3p、mi R-671-3p、mi R-9805-3p、mi R-9792-5p、mi R-9791-3p、mi R-423-5p和mi R-708-5p。通过q RT-PCR检测显示mi R-423-5p、mi R-128、mi R-9805-3p和mi R-708-5p在巴马香猪LD组织中表达量均显著高于约克夏猪（P（27）0.0001）;mi R-9791-3p、mi R-9798-3p和mi R-671-3p在约克夏猪LD组织中表达量均显著高于巴马香猪（P（27）0.0001）;mi R-9792-5p在两者LD组织中差异不显著。同时,这8个mi RNA的基础表达量均在0.15以下,均属于低效率mi RNA,推断来自mi RNA的Mb基因转录后负调控效应较小。综上,实验结果推断这些转录因子及mi RNA可能是影响猪肉色主要基因Mb基因的因素。本研究为揭示猪肉色形成机制提供了一种新的策略,为改良肉质性状奠定基础。