商业秘密作为一项特殊的无形资产，能给权利人带来实际或潜在的经济利益、竞争优势，是现代市场竞争的重要手段和工具。随着人类进入知识经济时代，商业秘密作为知识产权的一种，在社会的技术和经济发展中地位越来越重要。与此同时，科技的迅猛发展也使侵犯商业秘密犯罪的社会危害性日益明显。 本文主要从比较研究的角度，对侵犯商业秘密罪的理论争议、立法、司法疑难问题进行了探讨，总结完善我们自身的商业秘密刑事保护理论体系；适当借鉴国外相关立法司法的经验教训，提出强化商业秘密刑法保护意识、完善我国有关商业秘密刑事保护立法、改进司法的建议，以加大对商业秘密的刑事保护力度，使之与商业秘密的民事、行政保护一起形成合力，有力地维护权利人的合法权益，促进科技创新和进步，维护公平竞争的市场经济秩序，提升我国的国际竞争力，这也是本文论述的意义所在。 全文共分三章，第一章为商业秘密刑事保护的宗旨及历史沿革，本章主要阐述商业秘密刑事保护的宗旨、必要性，追溯了世界范围内和我国的商业秘密刑事保护历史沿革并加以比较，揭示了趋同的发展规律。 第二章是对商业秘密刑事保护理论的比较研究。首先，通过比较我国和国外及TRIPS协议对商业秘密概念及构成要件的不同规定、阐释商业秘密与专利的区别，明确了商业秘密刑事保护理论研究的逻辑起点——商业秘密的概念及其特性。其次，通过对大陆法系国家、英美法系国家与我国关于侵犯商业秘密犯罪规定的分析、比较、评述，明确商业秘密刑事保护理论研究对象——侵犯商业秘密罪的概念、特征。第三，重点阐述现阶段我国商业秘密刑事保护理论中争议较大、对立法及司法实践产生较大影响的问题，如本罪的罪过形式、本罪是否包括未遂形态以及罪数问题的研究。最后，在此基础上提出重构符合我国国情的商业秘密刑事保护理论的设想，作为本章的重点内容。笔者通过分析过失为罪的不合理性进而提出本罪的罪过形式应为故意；通过探究侵犯商业秘密罪未遂形态的现实可罚性，确认可审慎对侵犯商业秘密罪未遂犯进行定罪量刑，从而更好地实施刑法对商业秘密的保护 第三章我国商业秘密刑事保护的缺陷及完善是本文的重点章节。通过分析我国商业秘密刑事保护实体法和程序法上的缺陷，我国现阶段商业秘密刑事保护司法的不足如网络环境下取证难的问题、鉴定、与行政保护、民事保护的衔接及管辖问题等，从加强宣传，提高意识、完善立法、改善司法三个方面提出完善我国现阶段商业秘密刑事保护的对策。