小分子的药代动力学性质和毒性(ADMET)是药物研发过程中最关键的问题之一，差的药代动力学性质和不可接受的毒性是药物研发高失败率的原因，其中，药物诱导的心脏毒性占到了45％，而hERG毒性评价是心脏毒性安全性评价的关键指标，所以研究它具有非常重要的意义。本论文针对小分子的hERG毒性，通过计算机辅助药物设计，主要是构建定量构效关系模型来展开药代动力学性质及毒性的预测研究。　　第一章，我们介绍了构建QSAR模型的相关技术和流程。首先，简单地总结了QSAR的整个过程，包括基本概念和当前现状。然后我们介绍了QSAR模拟的基本步骤，如分子描述符的选择、合适数据集的确定、统计建模方法的运用以及模型验证。接着，还介绍了关键的步骤，如应用域、警示子结构和最大共同子结构。　　第二章，介绍了hERG的相关背景知识。hERG（humanether-a-go-gorelatedgene）属于电压门控钾离子通道，药物诱发的hERG阻断可能导致获得性长QT综合征和突然死亡。主要介绍了hERG的结构、作用位点、典型hERG药物及检测hERG的心脏毒性所用的试验。最后总结了目前对hERG的计算模型预测进展。　　第三章，采用从文献和相关数据库中收集整理得到的一共2191个小分子组成数据集，根据IC50=10μM和30μM作为标准，定义hERG阻断剂和非阻断剂，采用支持向量机构建分类模型。首先，我们使用PaDEL-Descriptor和chemotyper分别计算了MACCS和chemotyper分子指纹，然后用LibSVM构建分类模型，接着选用wombat-PK和PubChem的数据作为外部验证集验证模型。发现当分子指纹MACCS和普通描述符结合时，且阀值设定为10μM时所构建的模型，可以使两个外部验证集均提高13％。论文的最后部分，我们使用信息增益和chemotyper为hERG阻断剂和非阻断剂挑选警示子结构。