“中国基础研究的绩效分析及资金投入有效性实证研究”是国家自然基金委主任应急项目——“中国基础研究的资金投入与学术评价体系研究”之子课题，其研究目标为：在遵循基础研究发展规律的基础上，对我国基础研究活动的投入、成本和绩效给予科学的分析和评估，以正确引导科学研究工作者的学术行为，为实现创新国家的宏伟目标做出贡献。 本文的贡献在于，在充分把握基础研究绩效的基础上，归纳总结了基础研究绩效形式的传导机制模型，并提出了一套系统的宏观评估体系。借用这套评估指标体系，文章最后对目前中国的基础研究状况作出了评估。文章各章内容如下： 前两章分别为绪论与文献综述，主要概述了研究目标、意义，介绍了基础研究概念的衍化以及绩效形式。第三章主要介绍了基础研究评估的目的与两种主要的评估方法：科学计量与同行评议。两种方法各有利弊，因此在实际项目评估中，经常被同时交叉使用。由于本文的评估对象为目前整个中国基础研究的投入-产出状况，而非微观层面上的单个项目，因此，在评估方法上，更多地采用了科学计量的方法。第四章是在充分把握基础研究绩效发挥形式的基础上，建立了一套系统的宏观评估体系，并从理论与实证两个角度论证了指标体系的合理性。文章把基础研究的绩效定义为内部绩效与外部绩效，其中内部绩效分为创造理论知识，培养理论人才，外部绩效分为创造应用知识，培养应用人才，建立专业知识网络圈，创造经济价值等。相对应以上绩效形式，文章建立了基础研究的绩效评估体系。第五章在第四章提出的评估指标体系的基础上，对目前中国基础研究的状况作了实证研究。研究结果表明：基础研究内部绩效的发挥要优于外部绩效的发挥，理论知识向产业界的转化能力有限在一定程度上制约了外部绩效更好的发挥。但就总体而言，我国基础研究内外部绩效两者基本维持在一个动态的和谐状态。第六章对整篇论文进行回顾和总结，并就进一步研究的问题和方向进行展望。