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基于形态一地理学方法，通过野外调查，结合大量标本研究，在前人研究的基础上，对海南蕨类植物的分类进行了进一步修订；主要根据蕨类植物的现代地理分布，结合古生物学等有关资料，初步探讨了海南蕨类植物的区系性质与起源；根据IUCN2001年红色名录的等级和标准，对海南濒危蕨类植物的现状进行了初步评估，讨论了海南蕨类植物的受威胁原因，提出了有关保护的对策。主要结果如下：1． 海南现有蕨类植物56科140属439个种及种下分类群(包括421种、15变种、2亚种和1变型)，其中包括1个中国分布新记录和27个海南分布新记录，1新种--海南符藤蕨Teratophyllum hainanense：另有11个名称首次被处理为异名；澄清了海南假瘤蕨Phymatopteris hainanensis和圆顶假瘤蕨P.obtusa的模式问题，为滇桂三相蕨Ataxipteris dianguiensis、海南假瘤蕨P. hainanensis和浅杯鳞盖蕨Microlepia ampla指定了后选模式。2． 海南蕨类区系具有以下特点：i．以水龙骨科Polypodiaceae、金星蕨科Thelypteridaceae、铁角蕨科Aspleniaceae、叉蕨科Tectariaceae和观音座莲科Angiopteridaceae为表征科：ii．明显的热带性质，科的97． 5％、属的92． 5％、种的83． 6％为热带分布成分；iii．很高的物种多样性与物种密度，但属内种系贫乏；iv．与中南半岛的联系最为紧密，海南140个蕨类属中有136个与中南半岛共有，两地属的相似性系数达到87． 2％；v．海南蕨类区系就地起源于华夏古陆，起源时间可以追溯至早石炭世以前。3． 海南439种蕨类(包括421种、15变种、2亚种和1变型)中，183种为常见蕨类，113种属于资料缺乏的种类(DD)，47种属于近危(NT)，53种属于易危(VU)，37种属于濒危(EN)，6种属于极危(CR)。海南的受威胁蕨类植物有96种，海南的绝大部分受威胁蕨类植物都生于保护区以内或得到有效保护的林区之内，已初步得到保护。导致海南96种蕨类受威胁的因素，除了植物本身的生物生态学特性和地理分布上的限制外，主要是人类活动的影响，特别是海南森林在上个世纪被大规模砍伐。为了保护这些受威胁植物，应加强保护区和林区的管理，实施就地保护，积极开展迁地保护和人工繁殖。