【摘 要】
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背景:非综合征型唇腭裂(Non-syndromic orofacial cleft,NSOC)是由遗传和环境因素共同导致的,包括非综合征型单纯唇裂(Non-syndromic cleft lip only,NSCLO),非综合征型唇裂合并腭裂(Non-syndromic cleft lip with cleft palate,NSCLP)和非综合征型单纯腭裂(Non-syndromic cleft
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背景:非综合征型唇腭裂(Non-syndromic orofacial cleft,NSOC)是由遗传和环境因素共同导致的,包括非综合征型单纯唇裂(Non-syndromic cleft lip only,NSCLO),非综合征型唇裂合并腭裂(Non-syndromic cleft lip with cleft palate,NSCLP)和非综合征型单纯腭裂(Non-syndromic cleft palate only,NSCPO),其中非综合征型单纯唇裂和非综合征型唇裂合并腭裂又被称为非综合征型唇裂伴/不伴腭裂(Non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)。微小RNA(miRNA)是20-24bp的非编码RNA,通过碱基互补配对原则,降解m RNA或抑制靶基因的翻译。miRNA启动子和增强子区的单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphisms,SNPs),可以调控miRNA的表达和活性。目的:本研究旨在探究miRNA调控区SNPs与NSOC及其亚型的发病风险相关性。方法:本研究基于miRBase v22,UCSC common SNPs(150)和GEO数据库(GSE97752),鉴定出位于miRNA调控区(启动子和增强子)的SNPs。采用两阶段的病例-对照研究设计,包含2,004名NSOC病例以及1,891名健康对照。在一阶段,基于504名病例和455名对照的中国人群基因分型芯片数据,对与NSCL/P相关位点进行初筛。在二阶段,采用Taq Man基因分型技术在1,500名NSOC病例和1,386名对照中对筛选出来的位点进行基因分型,进一步明确易感位点。结合生物信息学分析以及一系列细胞分子生物学实验,揭示易感位点参与NSOC发生的可能生物学机制。结果:本研究共筛选出13,830个位于启动子区域的SNPs以及75,375个位于增强子区域的SNPs。经过一阶段初筛,选择其中两个最显著的位点(P<1.0E-04:增强子区rs3830766和同时位于启动子与增强子区的rs11564745)在二阶段进行了验证。我们发现hsa-miR-4260调控区rs3830766与NSCLO的隐性模型显著相关(P=0.007;OR=0.66,95%CI=0.49-0.89)。报告基因实验显示在人胚胎腭突间充质细胞(Human embryo palatal mesenchyme,HEPM)和人口腔上皮细胞(Human oral epithelial cell,HOEC)中,Deletion会降低增强子活性(PHEPM=0.003,PHOEC=6.45E-05);qRT-PCR实验显示单纯唇裂患者血清中hsa-miR-4260表达显著低于健康对照(P=0.026);细胞表型实验显示miR-4260 mimics会降低细胞增殖,增加细胞凋亡;双荧光素酶报告基因实验显示,在HEPM及HOEC中miR-4260 mimics与UBB结合。结论:rs3830766/hsa-miR-4260与NSCLO相关,可能会通过调控UBB导致NSCLO的发生发展。
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