适体筛选过程中检测方法的初步探索

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核酸适体是从随机序列中筛选出来的一段由DNA或RNA分子组成的寡核苷酸,能特异性地结合蛋白质、有机物小分子、金属离子等各种配体。通常是由20~60个碱基组成,通过指数富集配体系统进化(systematic evolution of ligands by exponential enrichment, SELEX)技术从人工构建的随机单链寡核酸文库里筛选出来。在核酸适体筛选的过程中,适体的监测和核酸适体的分离是筛选的关键,也是目前的两大难题。如何在筛选过程中对核酸适体进行有效的监测,成为了影响适体筛选的一个重要因素。本文在范茂棉筛选核酸适体方法的基础上,以双链随机DNA文库作为出发库,以不同的检测方法对可溶性和颗粒性靶标适体的筛选及筛选过程进行监测。文中探索了三种监测方法,其中酶活性抑制法效果不佳,血凝抑制试验及硫醇探针法可行。尤其是硫醇探针法是一种简单、灵敏、有效的监测方法,它不仅可用于适体筛选中的监测,还可用它建立所筛选适体快速检测靶标的方法,这为适体的筛选和应用拓宽了道路。1.酶活性抑制法监测p-内酰胺酶适体的筛选:用双链随机DNA文库作为出发库,以p-内酰胺酶作为靶标,经过1-3轮快速筛选,聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)显示有目的核酸条带,用该条带的纯化的和没有纯化的PCR产物作为检测对象。用碘量法测定了核酸对β-内酰胺酶活性的抑制试验,结果表明:筛选到的目的寡核苷酸片段不能有效抑制β-内酰胺酶的活性。2.凝血抑制试验监测人A、B和0型红细胞表面膜适体的筛选:同样以双链随机DNA文库作为出发库,人A、B和O型红细胞表面膜结构为靶标,经过1-3轮快速筛选,经PAGE电泳显示有目的核酸条带。用ABO血型定型试剂(单克隆抗体)对纯化的和没有纯化的PCR产物进行检测,采用血凝阻断试验检测该目的寡核苷酸片段的亲和力和特异性,结果表明:所筛到的目的寡核苷酸片段在规定时间内并不能阻断血凝。3.硫醇探针监测家蚕微孢子表面结构适体的筛选:用家蚕微孢子作为靶标,从双链随机DNA文库出发,经过1-3轮筛选,通过PAGE电泳证实在相应的位置有目的寡核酸条带。根据硫醇探针定性和定量检测硫醇的原理,建立了硫醇探针监测适体筛选过程的方法。优化了荧光素-5-马来酰亚胺硫醇荧光探针传感体系,并利用该体系检测了家蚕微孢子目的寡核苷酸的特异性,结果表明:该方法能作为适体筛选中的有效监测手段。此方法为核酸适体筛选过程中适体的检测提供了新的思路,使检测更加快捷、方便,而且可以进行示踪检测。
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