骨化黄韧带成骨相关基因表达谱的研究

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目的:应用RNA-Seq技术对正常黄韧带、非成熟型骨化黄韧带、成熟型骨化黄韧带转录组测序,寻求黄韧带骨化病程进展中的黄韧带骨化相关差异基因的表达,通过GO分析及KEGG Pathway分析探索差异基因相关的生物学过程和信号传导,为OLF的发病机制提供一些理论基础。方法:选取自2021年5月至2021年8月于宁夏医科大学总医院脊柱骨科确诊为多节段胸椎黄韧带骨化并行后路全椎板切除减压手术的3名患者,根据病变部位CT值定位分别采集3名患者术中离体的正常黄韧带、非成熟型骨化黄韧带、成熟型骨化黄韧带组织共计9例样本,并分别命名为正常组(N)、非成熟组(I)、成熟组(M)。用Trizol试剂提取样本总RNA,总m RNA质控后应用RNA-Seq技术获取N与I,I与M中的差异表达的m RNA,然后利用R软件对差异m RNA进行Geno Ontology(GO)和KEGG Pathway分析。结果:1.正常组(N)与非成熟组(I)之间共计筛选出1026条差异表达基因,其中上调408条,下调618条;2.非成熟组(I)与成熟组(M)之间共计筛选出713条差异表达基因,上调423条,下调290条;3.GO富集分析表明两组对比的差异基因在参与细胞对DNA损伤刺激应答、对压力的应答、刺激应答、细胞转化调控等生物学进程中显著表达;4.KEGG Pathway分析显示两对比组差异基因主要富集于MAPK通路、甲状旁腺激素(PTH)通路、破骨细胞分化通路、细胞外基质受体互相作用通路、黏着斑通路等信号通路。结论:1.正常黄韧带与非成熟型骨化黄韧带基因表达谱之间存在差异;2.非成熟型骨化黄韧带与成熟型骨化黄韧带基因表达谱之间存在差异;3.VEGF基因的表达在OLF非成熟骨化阶段表达增多,在OLF成熟型骨化阶段VEGF基因的表达呈下降趋势;4.JUND基因、ADCY2基因参与的PTH通路可能通过影响PTH的分泌、调控骨量的代谢参与OLF的发病过程;5.ECM-整合素-CSK信号通路可能参与力学因素所致OLF的发病过程;6.破骨细胞分化信号通路、黏着斑信号通路、MAPK信号通路可能参与OLF的发病过程。
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