牛疙瘩皮肤病毒ORF132的克隆、表达及生物信息学分析

来源 :西南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lpve530
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
牛疙瘩皮肤病(Lumpy skin disease,LSD)是牛的一种急性、亚急性传染病,由痘病毒科(Poxviridae)羊痘病毒属(Capripoxvirus,CPV)的牛疙瘩皮肤病毒(Lumpy skin disease virus,LSDV)引起。主要临床特征为病牛发热、皮肤表面出现大量疙瘩,致使牛的生产力下降,皮张鞣制后出现凹陷或孔洞,造成严重的经济损失,影响国际贸易和养牛业的发展。因此,OIE将其定为必须通报疫病,我国也将其定为进境动物一类传染病。该病在撒哈拉和马达加斯加等非洲国家和地区呈地方流行,近年来该病有向世界各地蔓延的趋势,目前已威胁到欧洲、中东和亚洲地区,其中,与我国毗邻的越南疫情较为严重。为防止该病传入我国,有必要建立并储备LSD监测方法和进行疫苗相关研究。本试验主要对LSDV-ORF132基因进行克隆表达,并对其二级结构、抗原性和功能等做了初步的预测和分析。主要研究结果如下:1.牛疙瘩皮肤病毒ORF132基因的克隆LSDV 与山羊痘病毒(Goat pox virus,GTPV)、绵羊痘病毒(Sheep pox virus,SPPV)基因组间的同源性非常高,但ORF132基因是与毒力和宿主范围有关的LSDV独有基因,其编码蛋白与其他已知蛋白缺少同源性。本试验采用原代羔羊睾丸细胞对南非LSDV弱毒株疫苗进行增殖培养,参照GenBank公布的Neethling vaccine LW1959株LW132编码序列设计带EcoR Ⅰ、BamHⅠ酶切位点的特异性引物,以病毒DNA为模板,通过常规PCR方法扩增目的基因LSDV-ORF132,将扩增产物经胶回收纯化后克隆至pMD-19-T克隆载体中,进行测序分析。试验结果显示:LSDV感染的原代羔羊睾丸细胞内出现胞浆内包涵体,接种24h后,细胞培养物内出现结节状聚集。PCR扩增出LSDV-ORF132原核表达片段,大小约542bp。测序结果表明LSDV-ORF132基因由534个核苷酸组成,GC含量为25.7%。与参照序列Neethling vaccine LW1959(AF409138)株LW132基因同源性为99%,在LSDV各毒株间高度保守,而与同属的GTPV和SPPV相应基因同源性低,具有较高的特异性,可作为生物标记用于羊痘病毒属LSDV、GTPV和SPPV的分子鉴别。2.LSDV-ORF132基因编码蛋白的生物信息学LSDV-ORF132基因编码177个氨基酸,蛋白分子量约为20.63 kD,其不溶性氨基酸残基为59.8%,表达形式疑为包涵体。采用丹麦Tekniske大学序列分析中心提供的在线分析工具和DNAStar的Protein模块进行信号肽、跨膜区、二级结构、亲水性、柔韧性、抗原指数的分析、B细胞表位预测,进行功能预测。结果表明:该蛋白无信号肽;肽链N端第4~21位的疏水氨基酸残基构成跨膜区;主要有3 个a-螺旋,7个β-螺旋,6个转角,无规则卷曲分别较散,没有形成大的区域;蛋白分子整体亲水性较好、柔韧性区域分布均匀、表面可及性较高,抗原指数较高的区域在 22-27,634-50,55-66,71-81,85-91,96-101,108-115,120-115,163-171区段上;B细胞抗原表位在35-42,61-65,71-76,95-99,107-114,120-125区段上。编码蛋白LSDV-ORF132用BLASTP搜索羊痘病毒属蛋白质数据库,结果表明LSDV与同属的山羊痘和绵羊痘处于明显不同的分支。从特异性和线性表位预测考虑,LSDV-ORF132 为筛选高效表达的理想抗原候选,将山羊痘和绵羊痘病毒得到良好区分,进而为进行诊断、免疫预防和治疗等方面的研究提供依据。3.LSDV-ORF132基因编码蛋白的原核表达通过设计的带EcoRⅠ、BanH Ⅰ酶切位点的引物,经PCR扩增出原核表达片段LSDV-ORF132基因,用双酶切、连接的方法将目的基因插入原核表达载体pGEX-6p-1、pET-32-a(+)中,从而构建重组表达载体pGEX/pET-ORF132。将重组表达载体转入工程菌JM109中,其重组菌经PCR、双酶切和测序鉴定后,将鉴定为阳性的重组表达质粒转入表达宿主菌BL21(DE3)中进行原核表达,经IPTG诱导下以包涵体的形式高效表达了蛋白分子量为47.45 kD和39.97 kD的蛋白。采用半干法将SDS-PAGE中蛋白条带转移至PVDF膜上,用鼠源GST/His标签抗体(1:1000)为一抗,兔抗鼠IgG-HRP(1:2000)为二抗,DAB为显色液进行Western blot。结果显示二个重组蛋白分别在47.45 kD和39.97 kD处有明显的显色带,表明二个重组蛋白可以作为抗原分别被抗GST单克隆抗体和抗His单克隆抗体识别,具有较好的反应抗原性,LSDV-ORF132可作为候选抗原,为诊断试剂的开发以及研制更有效、更安全的疫苗提供材料。
其他文献
本论文以中国古代舞蹈中的“垂手”动作为主要研究对象,从诗词描述入手,把词句掰开,充分研读并理解其中各词语的涵义,分别从读诗人和写诗人的心理角度,结合当时的文学审美特
环境恶化和能源短缺问题日益突出,高效清洁的能量转换技术的研发成为解决这些问题的关键。锂空气电池由于其理论比能量密度高而引起广泛关注,然而其正极发生的OER/ORR反应极
<正>笔者用热敏灸治疗采用碘治疗甲状腺功能亢进后出现顽固性头昏病1例,取得良好疗效,现报告如下:1临床资料患者罗某,女性,46岁,广州人。于2006年使用131碘治疗甲亢2个疗程后
专业实验目的是训练学生的专业技能,提高学生的综合素质.采用化学共沉淀法制备Ce0.8Sm0.2O1.9粉体,采用干压法压制成5×5×50 mm长条形样品和直径15 mm样片.用XRD对其结构进
众所周知,现实世界中存在大量的瞬息突变现象.用脉冲微分方程和脉冲泛函微分方程来描述含有这一现象的系统往往更加准确.脉冲微分系统是描述某一发展过程在一些特定时刻,其状
目的 参照GB/T16886.4-2003/ISO10993:2002,GB/T16886.6-1997/ISO10993-6:1994标准,评价国产NiTi合金(nitinol)支架应用于人体血管内的可行性。本实验包括植入后局部反应实验
对新工艺制备的 LC3 0 8型合成甲醇催化剂进行了实验室研究 ,讨论了反应条件对催化剂性能的影响 ,其性能较目前工业使用的同类催化剂有明显的改进 ,提高了催化剂的活性和热稳
本文主要探讨16排螺旋CT肺动脉造影( Computed Tomography Pulmonary angiography CTPA )与核素肺灌注/通气显像( ECT Ventilation-Perfusion ECT V-P)对肺栓塞(Pulmonary Em
受国家政策和国内外经济贸易大环境影响,对于传统瓦楞包装行业影响深远。原材料(原纸、辅料等)价格在动荡中呈上涨趋势,导致企业运营成本压力巨大。同时贵州XX彩印包装企业(以下简称XX公司)属于贵州包装行业的后起之秀,内部管理体系亟待建设,且受位置限制,技术力量薄弱、物流成本高、企业文化建设空白。同时外部竞争残酷,经历2017年和2018年上半年的价格大战后,整个市场的利润率维持在极低的水平。同时在建和
保障性住房(以下简称保障房)是社会保障的重要组成部分,泉州市的城镇住房保障制度伴随着泉州地改市已经历了三十年,历届政府都把保障中低收入住房困难家庭的基本住房需求作为