假结核耶尔森氏菌中Ⅵ型分泌系统效应蛋白YPK0405的功能鉴定

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细菌Ⅵ型分泌系统是近年来发现的一种新型的细菌分泌系统,存在于超过1/4已测序的革兰氏阴性细菌当中,主要分布于变形菌门、浮霉菌门和酸杆菌门。并且,它拥有一个在结构和进化上都与噬菌体尾部有着很高相似度的可收缩管状结构,可以将毒力因子分泌到环境中或者直接分泌到目标细胞的胞内,从而参与着诸如病原菌的致病性、细菌间的竞争、细菌抗击环境胁迫等重要的生物学过程。本研究以假结核耶尔森氏菌(Yersinia pseudotuberculosis)中T6SS-1基因簇上的一个未知功能的基因ypk0405作为研究对象,对其表达产物的生化功能/生理活性以及生物学功能进行了研究,对T6SS的功能进行了进一步的探索。研究结果如下:1.本研究通过细菌双杂交试验发现,YPK0405和YPK0406之间存在着相互作用,推测YPK0405和YPK0406是效应蛋白和免疫蛋白的关系;2.通过载体构建、诱导表达以及蛋白纯化,得到了YPK0405的重组蛋白,DNA水解活性检测试验结果显示,YPK0405具有DNA水解酶活性,并且这种活性依赖于2m M的镁离子;并且,通过YPK0405突变体及互补菌株的构建,本研究进行了上清水解试验,结果显示Δypk0405培养上清水解DNA的能力发生了下降;3.细菌分泌蛋白鉴定试验结果显示,YPK0405是一个可以分泌到胞外的蛋白,并且它的分泌依赖于假结核耶尔森氏菌中的T6SS-1;4.大肠杆菌异源表达试验显示,YPK0405在大肠杆菌胞内表达时对其有毒性,并且通过基因组提取试验发现,毒性可能来源于YPK0405对大肠杆菌基因组的降解;5.生理活性的测定结果显示,YPK0405在戊二醛交联12小时后出现了二聚体,;并且,PAR竞争试验显示,YPK0405是具有一定的锌离子结合能力。6.非生物表面生物膜试验结果显示,与野生型和互补菌株相比,Δypk0405在试管表面形成生物膜的能力发生了降低,说明YPK0405与假结核耶尔森氏菌在非生物表面形成生物膜的能力相关;并且,线虫表面生物膜试验显示,YPK0405同样与生物表面形成生物膜相关,并且T6SS-1也有类似的趋势。综上所述,本研究发现YPK0405是由假结核耶尔森氏菌中T6SS-1分泌的、拥有DNA水解酶活性的效应蛋白,它的活性依赖于2m M的镁离子。功能方面,YPK0405在大肠杆菌中异源表达时对其有毒性;并且,YPK0405可以通过一种未知的机制来影响假结核耶尔森氏菌在生物表面和非生物表面形成生物膜。
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