儿童幽门螺杆菌抗生素耐药相关基因的研究

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研究背景:幽门螺杆菌(helicobacter pylori, Hp)不仅是成人慢性胃炎、十二指肠溃疡、胃癌、胃黏膜相关淋巴组织瘤等疾病的重要致病因素,而且与儿童慢性胃炎、十二指肠炎、消化性溃疡的发生发展密切相关。Hp感染是一个全球性的问题,全世界人群感染率为50%。根除Hp已被证明可以减少胃癌的发病率,提高溃疡愈合。但由于治疗中抗生素的不合理应用导致抗生素的耐药,成为根除治疗Hp失败的主要原因。针对Hp目前广泛使用的治疗方案包括标准三联疗法,包括克拉霉素,阿莫西林、灭滴灵这三种主要的抗生素。最近的研究表明,潜在的抗生素耐药性主要是由于Hp的遗传基因突变。因此,检测耐药的Hp的基因突变,可以避免儿童抗生素滥用以及之后的多次耐药。本研究旨在初步了解儿童Hp耐药情况,并对一些抗生素的耐药基因进行研究。既往的耐药研究中大多采用基于培养基的敏感性测试,但它们不能确定具体的基因型。随着快速基因测序技术的发展,应用PCR来检测Hp,更具有指导意义。本论文采用PCR的方法,研究儿童Hp耐药菌株和敏感菌株之间的遗传基因突变情况,以明确克拉霉素,灭滴灵和左氧氟沙星耐药Hp菌株的基因信息。目的:研究儿童Hp耐药株耐药特性与相关基因突变的联系,为儿童耐药Hp的进一步研究提供一定的理论依据。方法:从儿童胃黏膜样本中分离培养80株Hp为出发菌株,用PCR的方法分别扩增敏感和耐药株的相关耐药基因,其中克拉霉素耐药株扩增23 S rDNA上约280bp片段;灭滴灵耐药株扩增rdxA和frxA基因部分序列,左氧氟沙星耐药株扩增gyrA和gyrB基因部分序列。通过DNA测序和生物信息学分析相关基因的突变情况,研究基因突变与耐药特性的内在联系。结果:80例Hp菌株中,克拉霉素耐药29株,耐药比例达到36.2%,相关耐药基因23S rDNA突变呈无规则状态,A2056G. T 2095 C和T 2157C三个突变点出现频率最高,分别达到90%、93%和100%,但是在敏感株中同样出现了这些点突变。灭滴灵耐药58株,耐药比例72.5%,相关基因rdxA出现以G47A和T184G为主的突变点,个别菌株中出现G60A、C273T和C49T突变点,敏感株中同样出现了T184G突变点,但未见G47A的突变点;frxA基因在敏感株和耐药株中均出现了A48G突变点。左氧氟沙星耐药12株,耐药比例为15%,耐药株gyrA基因出现的D91Y突变未在敏感株中发现,而在敏感株和耐药株中均出现了N87K突变和无义突变。结论:克拉霉素耐药Hp的23 S rDNA突变呈无规则状态;灭滴灵耐药Hp的rdxA基因出现的G47A突变可能与耐药相关;左氧氟沙星耐药Hp的gyrA基因出现的D91Y的突变可能与耐药相关。
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