论文部分内容阅读
目的:在潮汕地区近视人群中,探讨GWAS曾报道过的近视相关基因与近视和眼部生物参数的关系。
方法:我们一共招募了1,462名无血缘关系的长期定居在潮汕地区的中国汉族研究对象,其中包含110名轻度近视患者、244名中度近视患者、588名高度近视患者、254名极重度近视患者以及266名对照组人员。所有研究对象均进行了详细的眼科检查,眼部生物参数包括等效球镜度数、眼轴长度、角膜曲率、晶状体厚度、前房深度和玻璃体腔深度。我们采用TaqMan基因型分型法对27个GWAS曾报道的近视相关基因进行基因型鉴定。在6个遗传模型中计算相应关联性,并分析相应基因型与表型之间的关联性。
结果:除C1QTNF9B基因rs7331047外,其余所有单核苷酸多态性(Singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)均遵循哈迪-韦伯格平衡。我们发现4q25基因位点变异rs10034228与近视有显著的关联性(p=0.002;OR=0.56),并在亚组分析中与轻度、高度和极重度近视相关联。另外,基因型-表型关联分析表明,rs10034228的等位基因C与高度近视以及极重度近视患者高等效球镜度数(SETT=-8.85±4.74D,SETC+CC=-10.05±4.56D,p=0.003)以及厚中央角膜厚度(CCTTT=543.37±29.75μm,CCTTC+CC=550.19±36.78μm,P=0.017)有关。此外,MIPEP基因的rs9318086和15q14基因位点的rs524952与近视(p=0.042,OR=1.38;p=0.030,OR=1.37)和高度近视(p=0.004,OR=1.62;p=0.015,OR=1.49)有显著关联性。与此同时,基因型-表型关联分析表明,rs9318086的等位基因A与高度近视以及极重度近视患者高等效球镜度数(SEAA+AG=-10.16±4.46D,SEGG=-9.46±4.38D,p=0.040)、长眼轴长度(ALAA+AG=27.45±2.39mm,ALGG=27.00±2.00mm,p=0.018)、大角膜曲率(CCAA+AG=44.04±1.61D,CCGG=43.71±1.50D,p=0.029)、短角膜曲率半径(CRAA+AG=7.67±0.28mm,CRGG=7.73±0.27mm,p=0.036)以及大曲率比(AL/CRAA+AG=3.58±0.39,AL/CRGG=3.51±0.30,p=0.040)有关;而rs524952的等位基因A与高度近视以及极重度近视患者长眼轴长度(ALTA+AA=27.43±2.28mm,ALTT=26.97±2.24mm,p=0.033)相关联。值得注意的是,4q25基因位点的rs10034228、MIPEP基因的rs9318086和15q14基因位点的rs524952三者中两两之间在近视和高度近视组中存在相互作用。含3个风险等位基因以及含6个风险等位基因能增加患上高度近视的风险(p=0.043,OR=5.85;p=0.029,OR=10.00)。此外,15q14基因位点的rs4924134和ZC3H11B基因的rs10779363与轻度近视相关联(p=0.028,OR=1.77;p=0.016,OR=1.75),而在近视亚组分析中,15q14基因位点的rs634990与高度近视相关(p=0.021,OR=1.46)。
结论:本研究课题首先揭示了潮汕地区近视人群具有其地区特异性的近视相关基因,环境因素以及因人种差异所产生的遗传差异可能起到一定作用,但需更详尽的研究去论证。另外,本研究中3个近视关联基因(rs10034228、rs9318086、rs524952)与眼部生物参数存在相应的关联性。我们还发现4q25基因位点变异rs10034228、MIPEP基因变异rs9318086和15q14基因位点变异rs524952中存在相互作用,会增加患上近视或高度近视的风险,但其具体相互作用机制仍需进一步研究。
方法:我们一共招募了1,462名无血缘关系的长期定居在潮汕地区的中国汉族研究对象,其中包含110名轻度近视患者、244名中度近视患者、588名高度近视患者、254名极重度近视患者以及266名对照组人员。所有研究对象均进行了详细的眼科检查,眼部生物参数包括等效球镜度数、眼轴长度、角膜曲率、晶状体厚度、前房深度和玻璃体腔深度。我们采用TaqMan基因型分型法对27个GWAS曾报道的近视相关基因进行基因型鉴定。在6个遗传模型中计算相应关联性,并分析相应基因型与表型之间的关联性。
结果:除C1QTNF9B基因rs7331047外,其余所有单核苷酸多态性(Singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)均遵循哈迪-韦伯格平衡。我们发现4q25基因位点变异rs10034228与近视有显著的关联性(p=0.002;OR=0.56),并在亚组分析中与轻度、高度和极重度近视相关联。另外,基因型-表型关联分析表明,rs10034228的等位基因C与高度近视以及极重度近视患者高等效球镜度数(SETT=-8.85±4.74D,SETC+CC=-10.05±4.56D,p=0.003)以及厚中央角膜厚度(CCTTT=543.37±29.75μm,CCTTC+CC=550.19±36.78μm,P=0.017)有关。此外,MIPEP基因的rs9318086和15q14基因位点的rs524952与近视(p=0.042,OR=1.38;p=0.030,OR=1.37)和高度近视(p=0.004,OR=1.62;p=0.015,OR=1.49)有显著关联性。与此同时,基因型-表型关联分析表明,rs9318086的等位基因A与高度近视以及极重度近视患者高等效球镜度数(SEAA+AG=-10.16±4.46D,SEGG=-9.46±4.38D,p=0.040)、长眼轴长度(ALAA+AG=27.45±2.39mm,ALGG=27.00±2.00mm,p=0.018)、大角膜曲率(CCAA+AG=44.04±1.61D,CCGG=43.71±1.50D,p=0.029)、短角膜曲率半径(CRAA+AG=7.67±0.28mm,CRGG=7.73±0.27mm,p=0.036)以及大曲率比(AL/CRAA+AG=3.58±0.39,AL/CRGG=3.51±0.30,p=0.040)有关;而rs524952的等位基因A与高度近视以及极重度近视患者长眼轴长度(ALTA+AA=27.43±2.28mm,ALTT=26.97±2.24mm,p=0.033)相关联。值得注意的是,4q25基因位点的rs10034228、MIPEP基因的rs9318086和15q14基因位点的rs524952三者中两两之间在近视和高度近视组中存在相互作用。含3个风险等位基因以及含6个风险等位基因能增加患上高度近视的风险(p=0.043,OR=5.85;p=0.029,OR=10.00)。此外,15q14基因位点的rs4924134和ZC3H11B基因的rs10779363与轻度近视相关联(p=0.028,OR=1.77;p=0.016,OR=1.75),而在近视亚组分析中,15q14基因位点的rs634990与高度近视相关(p=0.021,OR=1.46)。
结论:本研究课题首先揭示了潮汕地区近视人群具有其地区特异性的近视相关基因,环境因素以及因人种差异所产生的遗传差异可能起到一定作用,但需更详尽的研究去论证。另外,本研究中3个近视关联基因(rs10034228、rs9318086、rs524952)与眼部生物参数存在相应的关联性。我们还发现4q25基因位点变异rs10034228、MIPEP基因变异rs9318086和15q14基因位点变异rs524952中存在相互作用,会增加患上近视或高度近视的风险,但其具体相互作用机制仍需进一步研究。