【摘 要】
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精神疾病是一种高发疾病,具有患病率高、复发率高、致残率高等特点。据不完全统计,中国成人精神障碍的终生患病率高达16.6%,对家庭和社会造成了巨大的负担和影响。在众多的精
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精神疾病是一种高发疾病,具有患病率高、复发率高、致残率高等特点。据不完全统计,中国成人精神障碍的终生患病率高达16.6%,对家庭和社会造成了巨大的负担和影响。在众多的精神疾病发病诱因中,新发变异(De novo variants,DNVs)是导致严重精神疾病的重要因素,新发变异如何影响精神疾病的发生与发展一直是一个热点研究问题。目前,高通量测序技术已经鉴定出大量的新发变异,并且已经有众多的科学家开展了相关的研究工作来了解这些变异在基因水平上的影响。然而,当前对于新发变异在mRNA转录本水平上的影响研究甚少。脑组织中涉及包含高频发生的可变剪接调控,并且比其他组织涵盖更多的剪接方式。Pre-RNA受到剪接体和剪接因子的相互作用后,会产生多个成熟的不同功能的mRNA同源异构体。在mRNA转录本水平上研究新发的影响是非常有必要的,以便更好地解释精神疾病发生的潜在机制。本文中,我们手工收集文献报道的新发变异数据并进行整合注释,同时集成大规模的组学数据,最后构建了一个包含全方位解析转录和翻译注释的新发变异集合,并可以识别可变剪接转录本特异性突变的精神疾病新发变异知识库PsyMuKB。PsyMuKB允许灵活地搜索基因或突变,并提供基于突变所在基因的信息描述和相关的可视化效果,例如表达,转录本基因组结构,蛋白质相互作用以及映射在蛋白质结构上的突变位点信息。此外,知识库还提供了易于使用的Web界面,允许用户快速查看突变的位置和特征以及受影响基因和可变剪接转录本的表达模式。本文开发的精神疾病新发变异知识库是一个多层次、多维度探索新发变异的综合资源平台,可用于识别组织特异性相关的变异,以进行相关疾病的分子通路与发病机理进一步研究的知识库。可从http://psymukb.com免费访问知识库。
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