核不均一核糖核蛋白F在脑胶质瘤中的表达及其调控作用研究

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ljj3061105011
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:脑胶质瘤是起源于神经胶质细胞的最常见的原发性颅内肿瘤,在我国,脑胶质瘤年发病率为5.8/10万。世界卫生组织(WHO)将脑胶质瘤分为Ⅰ~Ⅳ级,其中Ⅰ、Ⅱ级为低级别脑胶质瘤,预后较好,而以胶质母细胞瘤(GBM)为代表的Ⅳ级胶质瘤恶性程度最高,5年生存率不足6%。近年来,脑胶质瘤的诊断已经进入到分子时代,除了传统的组织学检测,分子亚型的检测日益受到人们的重视。如异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变、O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子区甲基化、α地中海贫血伴智力低下综合征X连锁基因(ATRX)突变、端粒酶逆转录酶(TERT)启动子突变等分子病理学特征,对脑胶质瘤的个体化治疗及预后判断具有重要意义。但是由于脑胶质瘤具有高度基因异质性,脑胶质瘤,特别是以GBM为代表的高级别胶质瘤的治疗仍然是一个挑战,需要继续寻找更敏感的标志物和更有效的治疗靶点。核不均一核糖核蛋白F(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F,hnRNP F)是一种具有RNA结合能力的蛋白,有研究表明,该蛋白广泛参与调节选择性剪接、前体mRNA加工、mRNA转录和翻译调节以及维持端粒稳定性等多方面功能,因此在癌症的发生和发展过程中都发挥重要作用。但是目前该蛋白与脑胶质瘤致病机制的关系尚不明确。本文研究尝试探索hnRNP F在人脑胶质瘤中的表达情况,并进一步挖掘其对肿瘤细胞生物行为学的影响及其内在机制。研究方法:1、利用TCGA和CGGA数据库中GBM及LGG的高通量测序数据进行生物信息学分析,探索hnRNP F的编码基因HNRNPF在不同级别和不同组织类型的胶质瘤中的表达差异情况,并分析其表达量与患者总体生存时间的关系。2、使用临床样本及胶质瘤细胞系,验证hnRNP F蛋白的表达情况。3、构建沉默和过表达hnRNP F的慢病毒,建立稳定转染的细胞系。4、采用CCK-8法、Ed U法、细胞集落实验、细胞划痕实验、基质胶侵袭实验测定沉默及过表达hnRNP F之后的胶质瘤细胞的增殖、迁移以及侵袭能力的变化。5、采用ELISA法测定VEGF以及血管生成实验,测定沉默及过表达hnRNP F之后的胶质瘤细胞的促血管生成能力。6、采用western blot检测沉默及过表达hnRNP F之后的胶质瘤细胞中,hnRNP F蛋白表达的变化情况以及上皮间充质转化(epithelial mesenchymal transformation,EMT)相关蛋白的表达情况。7、使用沉默hnRNP F的胶质瘤细胞系,做转录组测序及RNA免疫沉淀与高通量测序(RNA immunoprecipitation and high throughput sequencing RIP-seq),寻找hnRNP F蛋白结合并且参与调控的mRNA,并探索hnRNP F蛋白调控的下游通路。8、根据分析结果,验证PI3K-Akt通路的分子标志物的变化,并使用PI3K-Akt通路特异性抑制剂LY294002以及THBS2过表达质粒,验证hnRNP F蛋白是否通过调控THBS2的表达进而影响PI3K-Akt通路,从而发挥致癌作用。9、通过裸鼠皮下成瘤实验,以检测沉默或过表达hnRNP F后,肿瘤细胞在体内成瘤的能力变化。并取肿瘤标本,做免疫组化分析,探索肿瘤组织中hnRNP F、EMT相关指标、Ki-67等等的变化情况。10、联合分析转录组测序及RIP-seq的结果,寻找hnRNP F蛋白可能参与的可变剪切事件,并通过q PCR验证不同剪切异构体的表达情况。11、各项实验均独立重复3次以上,使用Graphpad Prism 8.0进行作图和统计,采用t检验进行组间比较,P<0.05被认为有显著的统计学差异。结果:1、对TCGA、CGGA数据库中的脑胶质瘤测序数据进行生物信息学分析,结果显示Ⅰ、Ⅱ级胶质瘤中HNRNPF基因表达量较低,Ⅲ、Ⅳ级胶质瘤表达量较高;按组织类型来看,少突星形细胞瘤中表达量较低,而GBM中表达量最高;而如果根据IDH和1p19q共缺失状态来分组,IDH突变型中表达量较低,IDH野生型及1p19q未缺失组的表达量最高。2、对临床样本的石蜡切片进行免疫组化研究,结果显示在GBM中,hnRNP F的表达量较高;同样在细胞系中,我们发现hnRNP F的表达量在高级别胶质瘤细胞系中表达最高,在低级别胶质瘤细胞系和正常细胞系中表达量较低。3、CCK-8细胞增殖实验、Ed U细胞增殖实验、克隆形成实验、裸鼠皮下成瘤实验、划痕实验、基质胶侵袭实验等证实,过表达hnRNP F后,U87细胞系细胞增殖、迁移、侵袭的能力增强,沉默hnRNP F后A172、U251细胞系的增殖、迁移、侵袭能力降低。4、ELISA法测定培养基VEGF浓度,结果显示沉默hnRNP F后U251细胞的培养基中,VEGF的浓度降低,过表达hnRNP F的U87细胞培养基VEGF浓度增高;血管生成实验显示,沉默hnRNP F后U251细胞的血管促血管生成能力降低,过表达hnRNP F后U87细胞促血管生成能力增强。5、经western blot实验发现,vimentin、MMP-2、N-cadherin、E-cadherin等EMT相关分子标志物有明显改变,这说明hnRNP F参与调控上皮间充质转化过程。6、沉默hnRNP F后行转录组测序,发现沉默hnRNP F后,上调的基因216个,下调基因52个,下调基因富集于PI3K-Akt信号通路。行RIP-seq实验,得到与hnRNP F结合的基因10193个,与hnRNP F结合并且转录水平随之降低的基因仅有30个,其中包括PI3K-Akt的上游分子THBS2的编码基因。由此我们推测,hnRNP F与编码THBS2的mRNA结合并调控其表达,进而通过下游的PI3K-Akt通路调控胶质瘤细胞的生物学行为。7、经western blot实验证实,沉默hnRNP F后U251细胞中PI3K和磷酸化AKT的表达降低,而过表达hnRNP F的U87细胞中PI3K和磷酸化AKT的表达升高。加入PI3K-Akt通路的特异性抑制剂LY294002后,可抑制hnRNP F过表达所导致的上皮间充质转化、细胞增殖能力增强、细胞侵袭及迁移能力增强。经PCR测定,沉默hnRNP F后,THBS2的mRNA转录水平明显降低,而过表达hnRNP F后THBS2的mRNA转录水平增高。对沉默hnRNP F的U251细胞转染THBS2质粒之后,可回复其对PI3K-Akt通路及EMT指标的抑制作用。8、裸鼠皮下成瘤实验同样证实,沉默hnRNP F使U251成瘤能力降低,过表达hnRNP F使U87细胞成瘤能力增强。取皮下成瘤的肿瘤组织,做免疫组化,结果显示过表达hnRNP F后,E-cadherin表达降低,N-cadherin表达增高,进一步证实hnRNP F可促进上皮间充质转化。结论:1、hnRNP F在人脑胶质瘤组织中高表达并与肿瘤恶性程度正相关,其表达量越高,患者预后越差;2、hnRNP F能促进人脑胶质瘤细胞的增殖、迁移、侵袭、EMT以及血管生成;3、hnRNP F能通过激活PI3K-Akt信号通路促进人脑胶质瘤细胞的增殖、迁移和EMT过程;4、hnRNP F可与THBS2的mRNA结合,调控其表达,进而调控下游PI3K-Akt通路。
其他文献
目的:遗传素质与环境因素的交互作用可以用来解释应激相关性精神疾病,包括抑郁症,焦虑症,创伤后应激障碍等的发病机制。生命中不同时期的应激包括成年后慢性应激和生命早期应激均对个体产生不良影响,易引发焦虑、抑郁等精神症状。饮食偏好与焦虑、抑郁症状的发生相关,调整膳食营养可能改善焦虑及抑郁的症状。本研究拟采用小鼠成年期慢性不可预知温和性应激模型(chronic unpredictable mild str
学位
目的:慢性阻塞性肺病(COPD)是一种慢性、进行性发展的肺部疾病,自从新型冠状病毒在全球范围内严重传播以来,人们越来越担心像COPD这样的慢性呼吸道疾病患者很容易被感染,并且更容易因为肺功能障碍而出现严重的疾病,甚至死亡。香烟烟雾是促使COPD疾病发生发展的一个重要因素。香烟烟雾可导致慢性炎症和氧化应激,从而导致COPD患者的肺结构及功能障碍。因此,预防和揭示香烟烟雾诱导COPD发生发展的调控作用
学位
研究背景及目的:老化导致的心血管系统结构和功能改变,是高血压、动脉粥样硬化等疾病发生发展病理生理学基础之一。血管老化突出表现为修复、新生能力降低,血管壁出现增厚、钙化,血管弹性及顺应性下降。弹性动脉这些变化,主要与血管平滑肌细胞(VSMC)衰老发生功能失调有关。当VSMC发生衰老时,可出现成骨样分化,细胞由张力型转变为分泌型,分泌多种炎性因子,诱发持久的氧化应激和炎性损伤,进一步破坏细胞外基质,导
学位
本文分析了日本PSE认证准入制度中对于带电动机-压缩机装置的要求,为该装置产品的第三方检测和PSE认证提供技术支撑,进一步规范产品的技术要求和市场行为,以期对中日友好、多边贸易和区域经济一体化相关工作有所借鉴。
期刊
原发干燥综合征(primary Sjogren’s Syndrome,pSS)是以淋巴细胞浸润泪腺,唾液腺等外分泌腺导致口腔、眼部干燥为特征的一类慢性的自身免疫性疾病。pSS可在任何年龄段发病,常见于中年女性,女性与男性患病比例为20:1。我国pSS患病率为0.5%~1%。pSS的发病机制和治疗靶点尚不明确。脑源性神经营养因子(Brain-derived neurotrophic factor,B
学位
背景和目的:天疱疮是一种严重的自身免疫性大疱性皮肤病,典型皮损表现为在正常皮肤或粘膜上发生松弛性水疱,易破溃,破溃后形成糜烂,组织病理学表现为表皮内棘层松解。寻常型天疱疮(pemphigus vulgaris,PV)和落叶型天疱疮(pemphigus foliaceus,PF)是两种常见的天疱疮亚型。目前公认的天疱疮的发病机制是:由于患者体内存在主要针对角质形成细胞间连接结构桥粒芯糖蛋白(desm
学位
研究目的:在男性恶性肿瘤中前列腺癌占第二位,全世界癌症死亡原因中占第五位,约10%(37.5万例)的男性癌症相关死亡事件是由前列腺癌引起的,这些年来前列腺癌的发病率和死亡率在我国呈现逐年上涨趋势。前列腺特异性抗原(PSA)广泛应用于前列腺癌早期筛查,但其敏感性及特异性存在一定的局限。因此,迫切需要新的生物标记物来更准确地用于前列腺癌的诊断及预测。多组学方法不仅可以更精准预测癌细胞对化疗或免疫治疗的
学位
目的:根据中国国家癌症登记研究所的数据,前列腺癌(prostate cancer,PCa)自2008年以来已成为最常见的男性泌尿恶性肿瘤。多模态磁共振成像(multiparametric magnetic resonance imaging,mp MRI)已成为检测临床有意义的前列腺癌(clinically significant PCa,cs PCa)的首选非侵入性检查技术。对于那些临床怀疑前列
学位
目的:胆石病(gallstone disease,GD)系肝胆外科常见病、多发病。在国内随着生活方式的改变,GD的发病率逐渐增加,尤其是50岁以上的人群。随着胆囊结石的形成,并发GD可导致致命性胆管炎和急性胰腺炎等严重并发症。GD危险因素可分为环境风险因素、人口风险因素和遗传风险因素等。然而,已报道大多数危险因素在不同国家和地区的人群中有所不同。长非编RNA(lnc RNAs)是长约200个核苷酸
学位
目的:慢性鼻窦炎(chronic rhinosinusitis,CRS)是临床常见的鼻腔鼻窦慢性炎症性疾病,在中国的患病率约为8%,带来沉重的经济和社会负担。作为一种异质性疾病,CRS病理生理学的相关分子机制仍未完全阐明。临床上,常根据息肉的伴发与否将CRS分为慢性鼻窦炎伴鼻息肉(chronic rhinosinusitis with nasal polyps,CRSw NP)和慢性鼻窦炎不伴鼻息
学位