2009年4月,新一轮的医改明确提出鼓励和引导社会资本进入医疗服务事业,伴随着扶持政策的不断出台,民营医疗机构成为资本竞逐的热点,已经成为我国医疗服务市场的重要组成力量。但一些民营医疗机构超范围经营、过度治疗,严重扰乱医疗市场。完善监管体系,规范民营医疗机构执业行为,有助于我国医疗服务整体质量的逐步提升,满足人们多层次的就医需求。本文以民营医疗机构卫生行政监管的核心概念界定为切入点,梳理民营医疗机构卫生行政监管体系构成,结合公共管理、政府失灵、信息不对称理论,对新医改背景下民营医疗机构卫生行政监管的现状进行归纳分析,新医改以来政府先后提出了降低准入门槛、改善执业环境等新要求,也推行了简化审批程序、双随机一公开等监管新举措,但我国民营医疗机构卫生行政监管仍存在监管主体局限、部门监管各自为政、监管手段落后、执法力度不足等问题,通过对存在问题进行深刻剖析,认为有资本自身办医定位不准、资本逐利、监管立法滞后、多头监管沟通不畅、监管短期化、监管环境复杂、各类监督力度不断加大等方面原因。通过借鉴国内外实践经验,对我国民营医疗机构卫生行政监管带来完善医疗法律法规、建立全方位监管体系、保证监管组织独立性等启示。进而提出加快医疗卫生基本法的出台、完善医疗监管法律法规体系、发挥第三方组织监管力量、建立民营医疗机构全过程监管体系、引导资本自身良性发展、构建民营医疗机构信用体系、引导社会力量参与监督等建议。