目的利用GEO数据库的高通量数据挖掘与乳腺癌早期诊断有关的分子标志物,并且探索目的基因的作用方式。方法1.通过检索GEO数据库,得到了三个与乳腺癌早期诊断相关的最优数据集GSE29431、GSE21422、GSE22544。2.将数据集分别用GEO2R分析后,筛选出三组差异表达基因,通过共词分析得出三组数据集共同的差异表达基因。3.将共同差异表达基因进行GO生物功能富集分析和KEGG信号通路富集分析,得出这些基因在生物体内发挥生物学作用最有意义的通路,并且得出基因的定位、生物学功能及参与作用的生物学进程。4.将具有生物学意义的通路内的基因构建蛋白质互作网络关系图,观察其间作用关系。5.通过Kalpan-meier plotter对差异基因进行生存分析,移除与乳腺癌预后不相关的基因后,将剩余基因分为高表达对乳腺癌预后有不良影响组以及高表达对乳腺癌有正性作用组。6.通过文献查询,将高表达对乳腺癌预后有不良影响组的基因进行筛选,提取出将该基因与乳腺癌进行关联研究较少的基因,将此类基因导入UALCAN,分析其表达情况,并进行生存分析二次验证,得出目的基因CKS2。7.GEPIA数据库分析CKS2在各个癌症中的表达情况。8.Human Protein Atlas（人类蛋白质图谱）中查询乳腺癌组织中CKS2的表达情况。9.查阅文献可知CKS2的表达与CDK蛋白相关,因而在GEPIA进行相关性分析。10.通过免疫组化法验证CKS2在乳腺癌组织及癌旁组织中的差异表达。结果1.三组数据集有交集的差异基因有748个,其中643个基因在乳腺癌中上调,105个基因为下调基因。2.KEGG分析得出差异基因主要通过PPAR信号通路、吗啡成瘾、AMPK信号通路等信号通路发挥作用。3.GO富集分析得出差异基因主要定位在细胞外泌体、脂质颗粒等处,参与血管生成、褐色脂肪细胞分化等生物学过程,起“结合肽激素、转录激活子活性”等作用。4.生存分析和文献筛选得出9个基因（CDC54、CCNB2、HFARP、CKS2、CIB2、PPP1R1A、DGAT2、ABHD5、HIP3）的高表达和总体存活率差的相关性有明显意义5.UALCAN里证实上述9个基因在乳腺癌中有4个基因上调,5个基因下调。但是生存分析验证只有CKS2的表达与乳腺癌的生存率显著相关。6.CKS2在多个恶性肿瘤中都处于高表达状态。7.乳腺癌组织中的CKS2也处于高表达。8.CDK和CKS2在GEPIA用Pearson相关性分析得出,CDK10与CKS2的相关性最强（相关系数最大）9.免疫组化的结果显示,CKS2在乳腺癌与癌旁组织中的表达差异有统计学意义。10.免疫组化结果显示,CKS2的表达与乳腺癌患者的肿瘤大小、WHO分级、淋巴结是否有转移以及脉管内是否有癌栓并无明显相关性。结论CKS2在乳腺癌中呈现高表达趋势,并且CKS2高表达的乳腺癌患者的生存率明显降低。另外研究发现CKS2主要的作用方式是通过与CDK蛋白的结合从而协调细胞周期的进程,因此这两个蛋白可以作为提升乳腺癌早期诊断研究的关键分子。