拟南芥染色质重塑蛋白BRM与光敏色素互作因子PIF1/PIF3互作参与光形态建成的分子机理

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光敏色素互作因子PIFs(Phytochrome-interacting factors)属于拟南芥中basichelix-loop-helix(bHLH)的第15类亚家族,它们为光形态建成的抑制因子。BRAHMA(BRM)是染色质重塑复合物SWI/SNF家族的成员,它对拟南芥的叶、花、根、果荚的形态起着重要的调节作用。本研究中,对红光和远红光生长条件下的突变体brm-1,brm-3,pif1 pif3和brm-3 pif1 pif3幼苗的下胚轴长度进行观测,结果表明brm-1,brm-3,pif1 pif3和brm-3 pif1 pif3突变体的下胚轴长度都比野生型的要短,这说明BRM参与了下胚轴生长的调控过程。同时本研究通过基因表达分析、组蛋白甲基化修饰水平检测、体外和体内蛋白互作分析等实验方法对BRM参与光形态建成的表观遗传调控机理进行了初步的探究。基因表达分析显示,促进细胞伸长相关的基因XTH7、XTH17、XTH33、LAA19、IAA20、EXPB1、EXP1、EXP3、EXP10、EXP14、TCG2和YUC5在突变体brm-3,pif1 pif3和brm-3 pif1 pif3中的表达量比野生型的要低。在对突变体brm-3、pif1 pif3和brm-3 pif1pif3中细胞伸长相关基因的染色质H3K27me3修饰水平进行分析发现,EXP B1的外显子区段以及IAA17的外显子区段的H3K27me3修饰水平升高。利用酵母双杂交实验方法,发现PIF1、PIF3能够与BRM的蛋白发生体外的相互作用。综上所述,染色质重塑因子BRM可能介由与转录因子PIF1/PIF3互作,并且共同调控细胞伸长相关基因XTH7、XTH17、XTH33、IAA19、IAA20、EXP B1、EXP1、EXP3、EXP10、EXP14、TCG2和YUC5的转录来调控下胚轴的伸长生长,此外,BRM和PIF1/PIF3抑制EXPB1和IAA17的表达水平可能与提高该基因位点的H3K27me3修饰水平有关。
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