杭州是一座江、湖、河、海、溪“五水并存”的城市,水是杭州的根和魂。在新的城市形态之下,杭州市提出从“五水并存”向“五水共导”转变的水域环境建设战略,并引导生态城市空间形态的发展建设。在一系列的实施举措中,2007年开始的“市区河道综合整治与保护开发工程”是杭州迄今最大的水系建设工程,解读这项工程对了解杭州生态城市建设的特点,丰富具有我国特色的生态城市形态的理论研究将有积极的意义。本文通过分析杭州城市形态和河道水系关系的演进过程,基于有机更新理论,去理解和分析杭州“市区河道综合整治和保护开发工程”,从而深刻地认知城市,找出纷繁复杂的城市发展表象背后的深层原因;基于城市形态理论,研究杭州“市区河道综合整治和保护开发工程”对杭州城市形态演变的影响,从而更好地为未来杭州解决城市发展过程中面临的现实问题,协调好老城区空间环境的历史沉淀对应现代化发展的关系提供依据,创造新时期宜人的城市空间,使城市有机、健康地发展。同时,通过对杭州“市区河道综合整治和保护开发工程”有机更新研究,为城市规划提供城市空间发展和城市空间特色塑造的历史依据,为城市规划和设计提供一定的指导原则。