HRR通路miRNA靶基因SNP与乳腺癌易感性关联分析及功能验证

来源 :郑州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:honfei1984
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乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,近年来其发病率呈不断上升的趋势,且发病年龄日益趋于年轻化,严重影响了女性的身心健康。目前研究认为乳腺癌的发生发展主要是女性生殖因素和遗传因素共同作用的结果,多项全基因组关联研究(Genome Wide Association Study,GWAS)发现同源重组修复(Homology RecombinationRepair, HRR)通路基因单核苷酸多态性(SNP)是个体DNA损伤修复能力差异的分子遗传学基础,miRNAs种子区以碱基互补配对方式与HRR通路靶基因mRNA3’非翻译区(3’UTR)特异结合,导致mRNA降解或抑制其翻译从而影响HRR通路基因的表达和功能,进而DNA损伤修复能力下降或缺失等引发的基因组不稳定是乳腺癌发生的重要原因。  目的:  探讨HRR通路miRNA靶基因单核苷酸多态性(MRE11A rs2155209、NBS1 rs2735383、RAD51 rs963917和 rs963918及 RAD52 rs7963551)与乳腺癌遗传易感性的关联以及与女性生殖因素的交互作用,为乳腺癌的个体化预防提供理论依据,且对筛选出的miRNA let-7b进行功能实验验证,为miRNA对HRR通路靶基因的调控机制提供依据。  方法:  (1)结合国内外文献数据库,采用生物信息学方法及相关miRNA靶基因预测软件筛选HRR通路miRNA靶序列SNPs;  (2)采用病例对照研究方法,在河南汉族人群中选取医院来源的乳腺癌病例450例,按年龄进行频数匹配选择社区来源的健康对照450例,采用PCR-RFLP和AS-PCR方法对五个位点进行基因分型检测,使用SPSS21.0软件并进行t-检验、卡方检验和非条件logistic回归模型分析,利用Hardy-weinberg平衡在线分析软件判断对照组是否具有人群代表性及SHEsis在线软件进行RAD51基因单体型分析,应用MDR2.0软件分析基因-生殖因素交互作用;  (3)采用分子克隆技术构建let-7b过表达载体,结合let-7b抑制剂分别转染到乳腺癌细胞系MCF-7和SKBR3内,采用qRT-PCR分析let-7b和mRNA RAD52的相对表达量及Western-blot分析RAD52蛋白表达水平进而判断RAD52是否是let-7b的靶基因。  结果:  (1)单位点分析结果显示:MRE11Ars2155209 TC(OR调整=1.87,95%CI=1.23-2.86)和TC+CC(OR调整=1.86,95%CI=1.23-2.80)基因型可增加乳腺癌发病风险,RAD52rs7963551 AC(OR调整=0.67,95%CI=0.48-0.87)、CC(OR调整=0.36,95%CI=0.24-0.58)和AC+CC(OR调整=0.71,95%CI=0.59-0.82)基因型可降低乳腺癌发病风险;  (2)分层分析结果显示:在具有乳腺癌家族史的女性中,rs2155209 TC+CC基因型(OR=1.49,95%CI=1.06-2.08)和rs963917TC+CC基因型(OR=1.78,95%CI=1.04-3.05)显著增加乳腺癌发病风险,rs2735383 GC+GG基因型在未绝经女性中可显著降低乳腺癌发病风险(OR=0.47,95%CI=0.33-0.66),rs963918 AG+GG基因型在生育次数≤2次的女性中乳腺癌发病风险较高( OR=1.64,95%CI=1.10-2.45),rs7963551 AG+GG基因型在母乳喂养女性中的乳腺癌发病风险较高(OR=1.49,95%CI=1.13-1.96),在PR阳性乳腺癌患者中,rs7963551 AC+CC(OR=1.82,95%CI=1.33-2.48)基因型均显示与较高的乳腺癌发病风险相关;  (3)五个位点联合效应分析结果显示:随着突变位点个数的增加,乳腺癌的发病风险呈现增加的趋势(Ptrend=0.003);  (4)单体型分析结果显示:RAD51基因Trs963917Ars963918和Trs963917Grs963918单体型可降低乳腺癌发病风险(OR调整=0.53,95%CI=0.4-0.68),而Trs963917Ars963918和Trs963917Grs963918单体型与乳腺癌发病风险增加相关(OR调整=1.28,95%CI=1.05-1.57和OR调整=1.31,95%CI=1.09-1.62);  (5)基因-生殖因素交互作用显示:携带rs2155209位点C等位基因和rs7963551位点A等位基因及具有乳腺癌家族史和母乳喂养经历的“高危”女性乳腺癌发病风险是非上述组合的“低危”女性的3.59倍;  (6)单双酶切电泳及测序结果显示:pGenesil-1-let-7b过表达载体构建成功;qRT-PCR结果显示在MCF-7细胞和SKBR3细胞中,let-7b和mRNA RAD52在let-7b过表达组和抑制剂组中的相对表达量差异均具有统计学意义(P<0.05);  (7)Western-blot结果显示:在MCF-7细胞中,let-7b过表达组中RAD52蛋白表达水平下调,let-7b抑制剂组中RAD52蛋白表达水平上调;在SKBR3细胞中,RAD52蛋白在let-7b过表达组和抑制剂组中的表达量差异均无统计学意义(P>0.05)。  结论:  (1)MRE11A rs2155209 TC/TC+CC基因型可能增加乳腺癌发病风险,RAD52 rs7963551 C突变等位基因可能降低乳腺癌发病风险,RAD51基因单体型CA、TA和 TG与乳腺癌遗传易感性相关,rs2155209、rs7963551、母乳喂养和乳腺癌家族史在乳腺癌发生中具有交互作用;  (2)pGenesil-1-let-7b过表达载体成功转染到人乳腺癌细胞MCF-7和SKBR3内,并在此两种细胞中成功上调了let-7b的表达水平,在MCF-7细胞中RAD52可能是let-7b的靶基因,且let-7b负性调节RAD52蛋白的表达。
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