高分辨熔解曲线技术检测多药耐药基因SNP的方法建立和应用

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目的:脑胶质瘤单纯手术难以根治,替莫唑胺(TMZ)是治疗脑胶质瘤常用的烷化剂,自TMZ应用于治疗脑胶质瘤以来,由于耐药性因素,对恶性胶质瘤的治疗有效率仅为45%,这已成为临床化疗的一个难题。有研究表明多药耐药基因(MDR1)外显子12的SNP位点C1236T是一种新的独立预测因素。以往的基因分型方法耗时,繁琐,成本高。本研究旨在建立一种新的灵敏度高、特异性强、简单快速、低成本检测基因分型方法,并探讨将该方法用于检测TMZ治疗胶质瘤耐药性可行性。方法:首先利用9例健康志愿者全基因组DNA,建立聚合酶链反应-高分辨熔解曲线(PCR-HRM)对C1236T进行基因分型的方法,并与测序结果相比较。在方法可靠的基础上,进一步对163例标本进行分型,获得中国人群该位点基因型比例。最后对26例临床治疗的胶质瘤患者直接进行检测。结果:PCR-HRM分型结果与测序一致,中国人群C1236T位点三种基因型C/C、C/T、T/T频率分别为9.2%、44.8%和46.0%,26例胶质瘤患者C/C、C/T和T/T分别有6、12和8例。结论:建立的高分辨熔解曲线对C1236T位点分型的方法是一种低成本、简便易行、高通量的方法,对监测胶质瘤病人的TMZ治疗抗性有一定的指导价值。
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