自改革开放以来，社会与经济发展速度加快，城镇不断融合，医疗水平的不断提升，人口总量大，资源消耗量增大，生态平衡被打破，环境问题不断凸显，水污染现象呈现于公众面前，水环境治理迫在眉睫。自十八大以来，国家已将生态文明建设提升至新高度，水环境治理也在如火如荼地开展。然而，在水环境治理中仍存在较多问题，例如存在部门职责划分不明、治理沟通不畅、治理成效不佳、治理成果难以维持等。
　　为了解决日益严重的水环境问题，中央决定在全国范围内推行“河长制”。“河长”由党政主要领导担任，并对管辖区域的河湖水环境治理与保护直接负责。“河长制”主要利用各级党政领导的行政权威，调动各级政府的治水积极性，有效协调各职能部门，共同治理河流水问题，希冀在短时期内取得显著成效。在河长制实施的过程中，面临着管理的碎片化和河湖的环境整体性矛盾，地方政府需要采取跨部门协同推进河湖的综合治理，更好地实现治理目的。
　　本文选取温江区“河长制”跨部门协同案例为主要研究对象，采用实地调研、案例研究等方法，通过使用整体政府理论，去探讨如何有效开展河长制中的跨部门协同，如何进一步提升水治理的成效。本文细致地分析温江区“河长制”中跨部门协同的运作现状，探讨跨部门协同的成效。并从中河长制协同现状中，总结温江区河长制跨部门协同存在的不足之处，分析深藏于现象背后的实质。得出以下结论：（1）温江区河长制的跨部门协同主要呈现出三种协同方式，横向上协同表现为同级政府不同涉水职能部门间沟通与联动，纵向上协同体现为四级河长上下协作，内外协同展现为区政府与非政府组织、个人的合作治水。（2）温江区河长制的跨部门协同取得了一定的成效，改善“九龙治水”的乱象，整合资源并提升治理效率，有效地减轻公众与政府间的距离感。（3）温江区河长制的跨部门协同还存在一些问题，例如协同主体能力不足，社会参与度不高，陷入“责任困境”、协同浮于表面，自利倾向行为导致协同效果不佳等。
　　再通过对全国范围内河长制实施经验介绍，提取其中值得借鉴的跨部门协同做法，有针对性的提出经验借鉴的改进方法，以便更好的实现河长制中的跨部门协同，实现河长制的治理目标，为其他地区的河长制的跨部门协同寻求更好的实施办法，为行政管理碎片化寻找解决途径。