基于亲和纯化-质谱定量分析P-TEFb调控HIV-1基因转录蛋白-蛋白相互作用研究

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艾滋病是由人类免疫缺陷病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)感染引起的获得性免疫缺陷综合症(Acquired immunodeficiency syndrome,AIDS),是一种以全身免疫系统严重损害为特征的严重传染性疾病。2008年法国科学家Francoise Barré-Sinoussi和Luc Montagnier因发现HIV病毒及其病理获得了诺贝尔生理与医学奖。艾滋病已经夺取了全球几千万人的生命,并且现在还有四千多万的携带者,但到目前为止仍没有任何一种治疗策略能够治愈艾滋病,如何阻止和根除HIV是摆在人类面前的巨大挑战。许多科学问题需要迫切地研究,尤其是在HIV感染宿主细胞的过程中,HIV与宿主细胞之间的相互作用分子机制是治疗HIV的关键,通过对HIV与宿主细胞之间的相互作用分子机制研究并最终找到根除HIV的治疗方法。  在HIV-1转录复制过程中,P-TEFb是所必需的宿主细胞因子之一。P-TEFb是由CDK9(Cyclin denpendent kinase9)及其调节亚基Cyclin T1组成的异源二聚体激酶,在HIV基因转录延伸过程中可磷酸化RNA polⅡ最大亚基上第二位丝氨酸,并克服负性延伸因子对转录延伸的抑制作用,从而保证全长mRNA的转录。  本文采用不同的HIV激活因子(HIV Tat、JQ1)以及P-TEFb的抑制剂(I-CDK9)来激活或者抑制基因的转录,运用定量蛋白质组学(quantitative proteomics)的方法来检测在HIV转录复制过程中以P-TEFb为核心的蛋白复合物的动态变化。在稳定整合HIV-1 LTR Luciferase的HeLa细胞为模型的基础上,构建了N1F9(稳定表达Flag-CDK9)稳定细胞株,运用亲和纯化-高分辨多级质谱联用分析(AP-MS/MS)和稳定同位素氨基酸标记质谱定量技术(SILAC)。我们研究发现:(1)在转染Tat后,LARP7、MePCE和Hexim1都降低,AF9、ENL、AFF1和AFF4都增加,这意味着Tat能使P-TEFb从7SK snRNP中解离,Tat募集SEC复合物到HIV基因的启动子上,从而利于HIV基因的转录。同时,还检测到了另外一个P-TEFb复合物降低10倍。(2)在经过JQ1处理后,发现7SK snRNP和SEC都没有明显变化,而另外一个P-TEFb复合物(即上文提到的P-TEFb复合物)增加15倍,这个复合物在HIV-Tat存在下降低非常明显,而在JQ1处理下增加非常明显,提示其在HIV转录复制过程发挥着重要功能,其具体的分子机制是什么我们正在研究。(3)在经过P-TEFb抑制剂I-CDK9处理后,LARP7、MePCE和Hexim1都降低,其他复合物没有什么变化,提示I-CDK9能造成7SKsnRNP解离,但并不能引起全局性的基因转录。  综上,本文采用定量蛋白质组学并联合AP-MS/MS的方法,系统地研究了以P-TEFb为核心的HIV基因转录过程中的蛋白复合物的动态变化,证实P-TEFb以及P-TEFb的复合物在HIV-1基因转录中发挥着重要作用,有望为艾滋病的根除及癌症治疗新药物的开发提供重要科学依据。
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