在“以房立家”的传统观念与社会经济快速发展的双重作用下,“炒房”热潮各地频发,在此背景下,作为房地产开发行业重要调控手段的土地增值税引发关注,但目前我国对于土地增值税的研究更多着眼于税务机关单方面或企业单方面,且由于土地增值税清算过程中涉及很多企业内部数据,难以通过财务报表等方式简单对外披露,基于税企双方角度对土地增值税清算差异的研究较少,通过案例方式呈现具体差异的研究更是寥寥,从税企双方角度出发的土地增值税清算案例研究显得尤为迫切。土地增值税清算过程中主要涉及收入的核算与成本的扣除,在实际清算过程中极少有税务机关审核清算结果与房地产开发企业自清算结果相统一的情况。本文运用了文献分析法、调查法、案例研究方法,从Z房地产开发公司与E市税务局由于清算差异最终引发的行政诉讼案件出发,通过走访税企双方工作人员,总结提炼数据并进行分析,最终发现,由于政策不周延导致的理解不同,各地政策执行口径不一、税企沟通不畅、企业出于节税目的的税收规避行为以及部分会计人员素质不高等因素,对可售面积、销售收入的确认,成分与费用分摊方法的选择,不可售面积是否参与成本分摊等问题的认知不同,最终导致了案涉企业与其主管税务机关审核清算结果的大相径庭。由点及面,作者对税企双方清算过程中如何减小差异,避免征纳矛盾提出了自己的建议,一方面企业人员要加强政策学习,掌握税务机关执法口径,完善清算准备,另一方面,税务机关更要加强纳税辅导,重视实地查验,强化双方沟通,这样才能最大程度地发挥土地增值税作为经济杠杆的重要调节作用,使企业实现纳税遵从,达到双方利益最大化。从理论意义上来说,作者希望能够通过研究实际案例,为土地增值税清算的税企差异研究提供自己的思考,以期丰富现行税制下的研究内容。从现实角度来讲,作者希望能够为税务机关解决土地增值税清算过程中的难点问题提供一些思路,并帮助企业规避涉税风险,避免不合理的资金占用,更进一步,为创建人诚税公的和谐征纳关系提出自己的思考。