南四湖是为南水北调东线工程的重要输水通道和调蓄湖泊，是衔接南北的主要调蓄枢纽，其战略位置十分重要。但是近年来由于缺乏对环境的保护，南四湖出现了一系列水安全问题，成为制约当地社会经济发展、威胁生态环境的重要因素之一，同时也成为南水北调东线工程建设的主要障碍。因此，了解南四湖流域的污染程度，评价湖区及入湖河流的水质现状，对于南四湖流域水体污染治理有一定的指导意义。本文结合实际情况，选取了5个湖区水质监测点和15条主要入湖河流作为研究对象，应用内梅罗指数法、模糊评价法、灰色关联评价法、聚类分析法、主成分分析法分别对南四湖流域的水质状况进行了分析，并对水质评价结果进行了分析，探讨了南四湖流域的污染原因以及防治措施。主要内容如下：（1）对南四湖5个湖区水质监测点的水质监测结果进行了综合水质评价，结果表明：南四湖湖区按污染程度可分为2大类，第一类的南阳湖、独山湖污染较严重，第二类的昭阳湖、微山湖污染较轻。湖区主要是有机物污染，富营养化严重。（2）选取南四湖周边15条主要入湖河流，分别对其污染程度进行了综合水质评价。结果表明，15条河流可分为3大类，第1类的光府河、城郭河、沛沿河污染最严重，其CODcr、CODMn和BOD5负荷较高，有机物污染严重。第2类河流的污染程度弱于第1类河流，这些河流周边生活区、工业带密集，接纳大量的生活、工业污水，污染因素类似，水质状况较差；第3类的新薛河、薛城小沙河、薛城沙河污染较轻，第1、2类中污染严重的河流主要分布在上级湖周边。（3）南四湖湖区自北向南入湖河流数量逐渐减少，污染负荷亦随之逐渐减小，水质状况逐渐增优，随河流汇入南四湖的污染负荷大部分集中在南阳湖和独山湖。南四湖作为南水北调东线在线湖泊，除必要的治污工程外，需完善入湖河流与南四湖的协同调度管理，改善调水期南四湖水质状况。