小麦是世界三大粮食作物之一,选育广适性小麦品种是应对全球气候变化,保障粮食安全的经济有效途径。然而,耐逆种质和基因资源的匮乏限制了小麦优异亲本的选择及分子育种效率。因此,发掘耐逆种质和基因资源是小麦育种研究的重点任务。本研究以三种小麦群体(自然群体、加倍单倍体群体及衍生系群体)为材料,在旱、热及盐等逆境环境下检测生理及产量性状,采用综合评价指标筛选耐逆种质资源;利用小麦660K SNP芯片检测基因型,结合全基因组关联分析及连锁作图方法,发掘小麦耐逆相关等位基因,主要结果如下:1.根据综合耐逆指数筛选出强耐旱种质21份,强耐热种质24份,强耐旱热种质16份,强耐盐种质24份;在多种逆境条件下均表现为强耐性的种质19份。2.全基因组关联分析检测到产量性状相关位点189个,其中,在多种环境下表现稳定的位点32个;连锁作图检测到产量性状相关QTL 135个,其中,与关联位点重合QTL15个。3.全基因组关联分析分别检测到与耐旱性、耐热性及耐旱热性相关位点64、27及30个,其中6个位点与多种耐逆性相关;连锁作图检测到耐旱(热)相关QTL46个,其中5个与关联位点重合。4.全基因组关联分析检测到耐盐性相关位点117个,连锁作图检测到耐盐性相关QTL27个,其中5个QTL与关联位点重合。5.发现与产量性状及耐逆性均相关的遗传位点5个,随着育种年代的推移,这些位点中产量性状相关优异等位变异或单倍型受到正向选择,使得相同位点中耐逆性相关优异等位变异或单倍型频率逐渐降低。6.在根系耐盐系数相关单倍域中发现盐胁迫响应基因TaRN1和TaRN2。TaRN1受盐胁迫诱导下调表达,TaRN2受盐胁迫诱导上调表达,盐敏感材料中TaRN2编码区存在序列缺失,导致该基因翻译提前终止。本研究发掘广适性小麦种质,揭示了多种耐逆性的遗传基础,为利用分子技术改良小麦提供了基因资源和技术支撑。