吉西他滨通过靶向WTAP蛋白沉默m6A-MYC抑制胰腺癌进展

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胰腺癌(PC)是一种高度恶性的、死亡率越来越高的肿瘤,其五年生存率仅为4%。绝大部分患者确诊后已经处于肿瘤晚期阶段,且转移明显,不适合手术治疗。N6-甲基腺苷(m6A)RNA甲基化修饰是最常见的转录后表观遗传化学修饰,越来越多的研究证明m6ARNA甲基化调节因子在许多癌症中过度表达,并通过对m6A的动态调节参与癌症的发展。然而m6ARNA甲基化作为治疗靶点仍不甚清楚。本研究旨在分析验证吉西他滨与m6A甲基化修饰之间的作用关系,用吉西他滨处理胰腺癌细胞后,通过检测m6A甲基化修饰水平、m6A甲基化相关调节子表达变化验证吉西他滨对m6A甲基化修饰的调节,探讨m6A作为吉西他滨治疗靶点抑制胰腺癌进展的作用机制。目的:探讨吉西他滨作为胰腺癌化疗药与m6A甲基化修饰水平的关系;通过检测吉西他滨处理后的胰腺癌细胞中m6A甲基化调节子的表达变化,确定吉西他滨抑制胰腺癌进展的m6A靶标;细胞功能实验验证靶标调节子对胰腺癌细胞增殖和迁移能力的影响;筛选受吉西他滨/WTAP调控的发生m6A修饰的下游靶基因;裸鼠体内实验验证吉西他滨对胰腺癌细胞成瘤能力及m6A甲基化修饰的影响。方法:①通过CCK-8、Transwell、EdU等实验检测吉西他滨对胰腺癌细胞增殖和迁移能力的影响;②用10ug/mL的吉西他滨处理胰腺癌细胞为实验组,未经吉西他滨处理的胰腺癌细胞设置为对照组,运用m6A 比色法定量试剂盒检测两组中m6A甲基化修饰水平,比较m6A水平的表达变化,并通过qRT-PCR检测比较m6A调节因子(Writers、Erasers和Readers)的表达变化。结合TCGA、GEO数据库分析m6A调节子表达差异性;③验证吉西他滨处理后m6A调节子蛋白表达水平,敲低靶调节子表达水平,通过细胞功能实验验证调节子对胰腺癌细胞增殖迁移能力的影响;④m6A2Target网站预测WTAP下游可能的靶基因,结合WTAP-IP和m6A-IP进行验证,肿瘤标本进行免疫荧光染色分析,检测上下游基因表达及其相关性;⑤预测并验证可能识别MYC上m6A修饰的阅读蛋白,确定m6A-MYC的上下游通路;⑥将对数生长期的5*106个胰腺癌细胞注入裸鼠一侧腋下皮下组织,成瘤后随机分为两组,PBS组和吉西他滨治疗组,吉西他滨治疗组小鼠将吉西他滨以50mg/kg浓度经腹腔注射入小鼠体内,五天一次,PBS组小鼠以同样方法剂量注射PBS,观察肿瘤生长速度、总体生存状态;⑦4周后处死小鼠,提取蛋白及石蜡包埋切片,通过免疫荧光、qRT-PCR等检测WTAP和MYC表达变化。结果:①与CCK-8和EdU检测发现吉西他滨处理显著降低了胰腺癌细胞的增殖能力,Transwell分析发现吉西他滨抑制了胰腺癌细胞的迁移能力;②吉西他滨抑制胰腺癌m6A修饰水平,且多个m6A甲基化修饰相关因子出现不同程度的表达变化,其中WTAP表达显着降低(FC=0.37,P<0.001),ALKBH5呈上升趋势(FC=1.6,P<0.05),TCGA和GEO数据分析发现胰腺癌中m6A相关蛋白出现不同程度的表达增加或降低,且WTAP在胰腺癌中上调,KEGG和GO富集分析显示与WTAP相关的差异基因可富集于细胞因子、代谢、内环境稳态等生物进程,结合实验和数据库我们认为WTAP为吉西他滨靶基因;③吉西他滨抑制WTAP蛋白表达水平,且WTAP敲低显著降低了胰腺癌细胞增殖迁移能力;④qRT-PCR验证发现,WTAP敲低后,靶基因MYC、HER2分别出现0.25倍和0.34倍下调,CDKN2A上调了 1.86倍。WTAP-IP及m6A-IP分析显示MYC被显著富集。胰腺癌标本免疫荧光分析发现WTAP和MYC共表达趋势显著;⑤吉西他滨也可以降低阅读蛋白IGF2BP1的表达,并且敲低了 IGF2BP1表达后,MYC稳定性也确实被抑制,K-M生存分析显示IGF2BP1越高预示着越差的生存时间;⑥吉西他滨治疗组的小鼠肿瘤生长速度,肿瘤大小和质量均小于PBS组;⑦qRT-PCR及免疫荧光分析发现吉西他滨显著抑制了 WTAP及MYC的表达。结论:我们的研究证实吉西他滨干扰胰腺癌中WTAP蛋白表达,从而降低MYC上m6A修饰以及MYC mRNA的稳定性,经由IGF2BP1识别后调节MYC蛋白表达,进而抑制MYC下游通路,起到抗胰腺癌进展的作用。
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