【摘 要】
:
目的:探讨多种测序技术在胶质瘤及VHL综合征中的诊断与预后分层的作用。方法:1)以TCGA-GBM、CGGA及GEO胶质瘤单细胞数据集(GSE162631)作为研究对象,整合单细胞数据与传统转录组(bulk-seq)数据,通过一致性聚类(ConsensusClusterPlus)构建一致性矩阵,对样本进行聚类,分析不同聚类与已有的TCGA分子分型的关系及不同聚类间的免疫浸润水平。2)以临床实践中收
论文部分内容阅读
目的:探讨多种测序技术在胶质瘤及VHL综合征中的诊断与预后分层的作用。方法:1)以TCGA-GBM、CGGA及GEO胶质瘤单细胞数据集(GSE162631)作为研究对象,整合单细胞数据与传统转录组(bulk-seq)数据,通过一致性聚类(ConsensusClusterPlus)构建一致性矩阵,对样本进行聚类,分析不同聚类与已有的TCGA分子分型的关系及不同聚类间的免疫浸润水平。2)以临床实践中收治的希佩尔-林道综合征为研究对象,综合运用Sanger测序、靶向测序确定致病位点,系统筛查确定临床表型。结果:1)模型可以将TCGA数据库的胶质瘤分为3个分子亚型(C1,C2,C3),他们之间存在显著的生存差异,C3预后较好,而C1亚型预后较差,我们使用同样的方法对CGGA数据库进行分子分型发现三个分子亚型预后也存在显著的差异。此外,根据既往的胶质瘤分子分型方法,我们发现C1亚型中Mesenchymal-like占比较多,而C3亚型中G-CIMP-low占比显著高于C1和C2亚型。IDH1基因在亚型之间的突变频率也存在显著差异,C3亚型中具有较多的突变频率。拷贝数变异方面,C3亚型的拷贝数扩增和缺失整体上高于C1和C2亚型。2)共发现7名希佩尔-林道综合征患者,4例有家族史,在基因型上,通过Sanger测序发现4种点突变,通过靶向测序发现2种大片段缺失。在临床表型上,均有中枢神经系统血管母细胞瘤,其中2例外显子缺失患者表型特殊,分别患有球后血管母细胞瘤与卵巢交界性肿瘤。结论:本研究发现转录组水平测序数据可以有效地对中枢神经系统常见胶质母细胞瘤患者进行预后分层,S anger测序可以较好地完成中枢神经系统罕见肿瘤(VHL综合征)的诊断,同时NGS靶向测序也可以作为一个有效的补充测序方法。针对神经系统可能的多基因疾病与单基因疾病,可以采取不同形式(转录与突变,单细胞与bulk-seq)的测序方法对疾病进行精准诊断与预后分层。
其他文献
文言文是中华优秀传统文化的重要载体,在文化的传承中得到了发展并获得了强大的生命力。文言文与优秀传统文化从来就有着天然的联系。《普通高中语文课程标准(2017年版2020年修订)》指出,应“引导学生通过中华传统文化经典作品,积累文言阅读经验,培养民族审美情趣,增强对中华优秀传统文化的理解,提升对中华民族文化的认同感、自豪感,增强文化自信,更好地继承和弘扬中华优秀传统文化。”长期以来,高中文言文教学过
当前,新型冠状病毒COVID-19正在全球肆虐,治疗新冠肺炎及其并发症离不开大量的抗生素,这些过量的抗生素进入水源无疑会造成很大的危害,而且废水中污染物成分复杂,因此迫切需要一种经济高效的手段来处理废水。半导体光催化技术已被证明对环境修复有很好的效果,选择和开发合适的光催化剂仍是当前光催化领域的重要内容。由于BiOBr具有较高的光催化活性与稳定性以及适中的禁带宽度,被认为是具有很好发展前景的半导体
克孜尔石窟地处我国新疆维吾尔自治区拜城县克孜尔乡东南方七公里的木扎提河北岸,却勒塔格山对面的明屋塔格悬崖壁上。作为龟兹佛教文化最有代表性的艺术圣地,石窟内现有壁画约四千平方米。克孜尔石窟经历了千余年的沧桑变迁,曾遭遇过俄国、英国、法国、德国、日本等国的掠夺,又遭受了自然的严重破坏,虽洞窟窟体已经残破,所幸壁画保存相对完好,这些光彩陆离极具龟兹风格的壁画,是龟兹佛教宝贵的艺术遗存。所以,对克孜尔石窟
光催化氧化技术利用半导体将太阳能应用于水体净化,受到了广泛的研究。苝酰亚胺(Perylene dimide,PDI)具有较高的光与热的稳定性、合适的能带结构(Eg=1.78e V)以及较好的可见光吸收范围(可吸收<700 nm的光),被认为是一种具有实际应用前景的光催化材料。然而,本征PDI光催化材料的光生电荷复合严重,使其光催化活性较低。目前,科研工作者提出了多种方法与策略以改善PDI材料的光催
生死书写,是文学创作常见的主题。而严酷的地理环境,更使得人们对生与死尤为看中。作为“极地之女”的当代实力派作家迟子建,以一腔悲悯和满腹情怀执著地书写着“北世界”芸芸众生的生死歌哭,通过对生与死的思考、呈现,表达其对人生、人性的关注与拯救,包裹着对生命能量的赞美。全文除绪论和结语外主要分为三大部分:第一部分着重探讨迟子建小说中对生死的呈现。一方面,迟子建的小说表现出悲悯光照下的死亡哲思,敞开死亡的必
在路翎四十年代的小说中可以看到不同的死亡群像,而与死亡书写相伴而生的是他对生命原始强力的高度认可和对生存价值的极度关切。如果说四十年代初期小说的死亡惨像是作家渴望用苦难唤起个体向黑暗搏斗的力量,那么四十年代中、后期书写死亡则是通过对人物生命历程的阐释彰显着作家对死亡意义和生命强力的不断探索。除了引言和结语,论文主要分为四章进行论述:第一章,探讨路翎四十年代小说死亡书写的人物类型。主要包括以下三类人
在我国古代历朝的发展长河中,榷茶制度始设于唐德宗贞元九年,两宋时期榷茶力度逐步增加并到达顶峰。茶利作为政府财政收入的重要组成部分备受政府的关注,尤其是南宋时期,政府面对高额的军费支出和官员俸禄,茶业成为了政府必须垄断和掌握的部分,以源源不断获取茶利。自古以来东南地区就是我国重要的茶业产区,两宋时期东南茶的地位逐渐上升,产量和质量都得到了飞跃式的进步,逐渐超过了川茶。私茶现象伴随榷茶而生,虽然私茶自
医疗纠纷是医患矛盾关系的重要表现形式,会引发暴力冲突,干扰正常医疗秩序,加重医务人员心理负担,使缺乏安全感,工作热情降低,有意识的规避高风险医疗操作,顾虑新技术和新方法的使用,出现“防御性医疗”行为,俨然成为影响医疗机构正常运转、阻碍医疗卫生事业发展和医学技术创新的棘手问题。受多种因素影响,我国现阶段的医疗纠纷问题突出,已经成为同时困扰医疗和司法两大领域的难题,如何预防减少以及有效解决医疗纠纷成为
伴随着科学技术的发展,药物废水中的有机污染物种类和和毒性逐渐增加,因此需要探寻处理药物废水的有效方式。声催化氧化法是一种新兴的处理水中有机污染物的技术,具备操作简单、可实用性强、无二次污染等优势。Bi Fe O3是一种具有独特结构的铁磁性材料,在光催化、储能等领域应用广泛,但其在声催化领域的研究还未展开。本研究将Bi Fe O3作为声催化剂,探究其与超声技术联用后的声催化活性,并通过构建复合物的形
大方漆器是贵州省大方县当地彝族漆器髹饰技艺的代表手工技艺,距今已有600年的历史,在2008年被列入国家级非物质文化遗产名录。但由于缺乏核心产品、营销方式落后,正面临发展传承的窘境。本文选择大方县G漆器公司作为研究对象,运用文献研究、调查访谈、案例分析等方法,在实地调研的过程中,对公司的产品销售中出现的问题进行总结,先利用PEST、波特五力模型等理论对G漆器公司进行营销环境的分析,再利用SWOT分